232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2002 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  51.96 
 
 		 312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  48.04 
 
 		 310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  47.06 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  49.02 
 
 		 310 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  49.03 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  45.42 
 
 		 310 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  47.88 
 
 		 309 aa  288  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  47.73 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  47.59 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  47.27 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  46.58 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  47.39 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  44.59 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  46.73 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  46.75 
 
 		 310 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  47.06 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  43.97 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  46.73 
 
 		 309 aa  275  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  46.67 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  46.67 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  42.67 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  46.08 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  46.08 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  46.08 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  44.92 
 
 		 310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  45.75 
 
 		 310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  47.18 
 
 		 313 aa  272  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  45.75 
 
 		 310 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  45.42 
 
 		 310 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  45.42 
 
 		 310 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  48.21 
 
 		 309 aa  271  8.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  45.75 
 
 		 314 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  43.55 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  45.1 
 
 		 310 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  45.1 
 
 		 310 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  45.28 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  44.77 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  43.97 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  45.42 
 
 		 310 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  45 
 
 		 321 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  45.57 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  45.57 
 
 		 311 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  43.65 
 
 		 310 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  45.45 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  44.63 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  44.48 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  44.81 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  43.32 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  43.65 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  43.14 
 
 		 309 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  43.52 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  42 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  44.95 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  42.35 
 
 		 311 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  40.2 
 
 		 273 aa  205  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  37.87 
 
 		 273 aa  202  6e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  39.25 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  37.17 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.42 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  38.08 
 
 		 321 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  34.65 
 
 		 273 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  38.46 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  37.33 
 
 		 272 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  38.33 
 
 		 272 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.64 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  35.64 
 
 		 272 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  38.33 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.75 
 
 		 271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  36.69 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  37.03 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  34.68 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  34.11 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  36.59 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  35.91 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  33 
 
 		 293 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  33.02 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  33.89 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  36.67 
 
 		 281 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  35.2 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  36.3 
 
 		 288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  34.8 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  35.43 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  32.39 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  34.32 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  32.28 
 
 		 297 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  32.91 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  32.39 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  32.39 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  32.39 
 
 		 294 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  35.31 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.34 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  32.33 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  31.76 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  35.64 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  34.32 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  30.82 
 
 		 453 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.48 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>