233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3203 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  85.42 
 
 		 288 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  84.03 
 
 		 288 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  82.81 
 
 		 288 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  82.87 
 
 		 288 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  65.26 
 
 		 294 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  64.81 
 
 		 294 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  64.81 
 
 		 294 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  64.46 
 
 		 290 aa  404  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  65.16 
 
 		 294 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2814  hypothetical protein  60.76 
 
 		 290 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  39.29 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  36.71 
 
 		 296 aa  169  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  35.66 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  35.79 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  30.72 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  34.02 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  35.29 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  33.8 
 
 		 273 aa  149  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  33.57 
 
 		 275 aa  149  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  35.2 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  143  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  34.3 
 
 		 299 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  32.42 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  32.99 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  31.94 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.12 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  32.09 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  32.09 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.42 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  33.01 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  31.97 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  32.07 
 
 		 279 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  34.32 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  30.58 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  32.34 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  31.37 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  30.82 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  33.11 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  33.1 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  29.87 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  32.25 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  30.29 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  29.79 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  33.89 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  32.25 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  32.57 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  32.25 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  28.99 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  33.91 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  31.05 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  34.13 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  32.35 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  29.51 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  29.74 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  30.69 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  32.3 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  32.89 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  30.85 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  30.16 
 
 		 313 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  30.39 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.11 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  32.79 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  31.6 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  32.45 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.47 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  31.6 
 
 		 272 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  33.91 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  32.14 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.6 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  31.97 
 
 		 276 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  28.52 
 
 		 453 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  29.32 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  32.65 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  32.68 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  29.45 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  32.31 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  30.1 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  31.05 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  29.74 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  30.17 
 
 		 279 aa  119  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.44 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  29.24 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  30.21 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  30.16 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  29.51 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  31.47 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  27 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.31 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  30.9 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  28.29 
 
 		 310 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  30.72 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  29.25 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  30.72 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  30.72 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  28.34 
 
 		 310 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  31.05 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  30.62 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.57 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  28.52 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>