243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0314 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  92.86 
 
 
280 aa  525  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  71.53 
 
 
281 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  64.34 
 
 
303 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  64.36 
 
 
276 aa  345  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6838  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  52.04 
 
 
266 aa  241  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  44.07 
 
 
273 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  41.39 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  38.89 
 
 
272 aa  189  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  35.66 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  38.01 
 
 
289 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  39.64 
 
 
273 aa  171  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  38.41 
 
 
272 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  38.03 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  38.03 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  38.03 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.9 
 
 
271 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  37.01 
 
 
281 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  36.36 
 
 
282 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  34.77 
 
 
311 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  37.18 
 
 
281 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  34.96 
 
 
272 aa  148  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.79 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  33.78 
 
 
293 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  36.76 
 
 
274 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  36.82 
 
 
281 aa  145  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  35.23 
 
 
281 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  35.66 
 
 
274 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  34.8 
 
 
280 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  35.9 
 
 
274 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  32.85 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  32.49 
 
 
293 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  35.53 
 
 
279 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  35.53 
 
 
283 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  35.25 
 
 
277 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  32.07 
 
 
290 aa  135  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  32.97 
 
 
274 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  32.61 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  35.16 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  35.13 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  30.71 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  33.44 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  32.25 
 
 
453 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1554  protein of unknown function DUF849  35.4 
 
 
278 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  32.75 
 
 
287 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1354  hypothetical protein  35.4 
 
 
278 aa  132  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.291809  normal  0.536847 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  36.5 
 
 
280 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.51 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  31.88 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  31.97 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  31.42 
 
 
293 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  29.35 
 
 
449 aa  125  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  35.33 
 
 
309 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  33.33 
 
 
321 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  30.54 
 
 
297 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.62 
 
 
305 aa  122  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.77 
 
 
296 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  31.02 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  31.96 
 
 
304 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  34.11 
 
 
296 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  32.31 
 
 
316 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  35.03 
 
 
301 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  31.31 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  30.51 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  33.67 
 
 
309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  30.54 
 
 
297 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  30.03 
 
 
310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  30.85 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  29.49 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  33 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  30.36 
 
 
310 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  28.47 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  27.8 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  32 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  30.88 
 
 
288 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  32.21 
 
 
315 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  31.62 
 
 
311 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  32.42 
 
 
290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  32.12 
 
 
309 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  30.33 
 
 
308 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  30.15 
 
 
288 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  32.12 
 
 
309 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  32.12 
 
 
309 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  34.32 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  34.32 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  29.19 
 
 
326 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  34.32 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  32.12 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.27 
 
 
294 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  31.37 
 
 
288 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  32.21 
 
 
299 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  30.9 
 
 
310 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  32.56 
 
 
303 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  31.56 
 
 
309 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  30.87 
 
 
294 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  29.35 
 
 
288 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  32.79 
 
 
309 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  32.79 
 
 
309 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  32.12 
 
 
309 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>