188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6838 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6838  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  100 
 
 		 266 aa  494  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  51.67 
 
 		 280 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  52.04 
 
 		 280 aa  241  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  47.01 
 
 		 276 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  48.52 
 
 		 281 aa  208  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  43.07 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  38.7 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  33.58 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  30.77 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  32.94 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  36.16 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  30.98 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  35.77 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.85 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  29.01 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.14 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  29.5 
 
 		 453 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  34.75 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  34.75 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  28.62 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.39 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  26.85 
 
 		 449 aa  94.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  30.27 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  29.23 
 
 		 293 aa  89  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  29.86 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  28.03 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  32.62 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  28.21 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  27.72 
 
 		 297 aa  85.9  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  28.11 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.49 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  27.44 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  30.63 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  29.84 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  28.9 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  27.61 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  28.62 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  28.2 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  29.76 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.35 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  32.34 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  32.02 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.01 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  28.9 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  29.58 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  30.89 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  29.27 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  27.41 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  27.52 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  30.85 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  31.21 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  30.85 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  30.85 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  30.85 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  30.48 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  31.75 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  27.82 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  29.15 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  29.15 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  30.5 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  27.24 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  30.85 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  29.26 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  30.85 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4715  hypothetical protein  26.87 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155352  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  27.78 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  29.79 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  29.26 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  28.78 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  29.18 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  27.7 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  27.57 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  30.85 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3085  hypothetical protein  24.22 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3856  hypothetical protein  30.26 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  29.24 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  27.72 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  30.5 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  27.87 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  30.5 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  30.5 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  29.33 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  30.11 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  30.5 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  28.88 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  28.88 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  27.44 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  30.5 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  30.4 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  28.42 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  30.5 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  30.5 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  28.2 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  25.69 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  26.69 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  29.13 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  27.78 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  33.11 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  28.3 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  29.18 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>