272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2080 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  100 
 
 
453 aa  947    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  53.45 
 
 
449 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  52.11 
 
 
293 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  50.89 
 
 
293 aa  293  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0948  hypothetical protein  69.33 
 
 
156 aa  229  8e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  39.49 
 
 
275 aa  197  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  39.05 
 
 
289 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  38.18 
 
 
272 aa  190  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  39.05 
 
 
273 aa  188  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  36.82 
 
 
273 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  37.81 
 
 
283 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  37.18 
 
 
282 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.63 
 
 
280 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  36.1 
 
 
281 aa  170  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  35.25 
 
 
281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.5 
 
 
271 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  34.42 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  37.05 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  34.77 
 
 
277 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  36.69 
 
 
274 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  35.14 
 
 
277 aa  156  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  36.03 
 
 
272 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  32.19 
 
 
297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  32.53 
 
 
297 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  33.7 
 
 
281 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  34.28 
 
 
287 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  33.45 
 
 
279 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  34.03 
 
 
293 aa  152  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  34.3 
 
 
276 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  37.09 
 
 
280 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.21 
 
 
305 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  33.46 
 
 
272 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  32.4 
 
 
292 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  32.65 
 
 
290 aa  144  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  34.01 
 
 
295 aa  144  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  34.13 
 
 
294 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  33.79 
 
 
294 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  33.79 
 
 
294 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  32.99 
 
 
299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  30.77 
 
 
321 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  32.99 
 
 
294 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2136  GCN5-related N-acetyltransferase  44.3 
 
 
157 aa  140  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000941211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  33.1 
 
 
295 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  30.87 
 
 
301 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  31.47 
 
 
280 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  32.35 
 
 
272 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  31.67 
 
 
281 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.47 
 
 
272 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  32.65 
 
 
295 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  32.25 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  33.56 
 
 
309 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  32.99 
 
 
309 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  32.99 
 
 
309 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  32.99 
 
 
309 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  32.76 
 
 
293 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  32.65 
 
 
309 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  31.53 
 
 
311 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  32.3 
 
 
309 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  32.1 
 
 
272 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2908  hypothetical protein  42.76 
 
 
158 aa  133  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  32.25 
 
 
280 aa  133  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  32.3 
 
 
309 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  32.3 
 
 
309 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  32.65 
 
 
309 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  31.96 
 
 
309 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  31.96 
 
 
309 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  32.3 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  32.3 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  32.65 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  34.05 
 
 
274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  31.62 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  30.48 
 
 
298 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  30.24 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  30.82 
 
 
326 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  32.87 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  31.29 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  30.9 
 
 
283 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  33.69 
 
 
274 aa  131  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  32.99 
 
 
309 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  32.99 
 
 
309 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  31.73 
 
 
272 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  33.69 
 
 
274 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  31.56 
 
 
303 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  31.62 
 
 
312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  30.26 
 
 
312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  30.96 
 
 
279 aa  128  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.47 
 
 
303 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  32.45 
 
 
293 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  32.31 
 
 
308 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  32.13 
 
 
281 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  32.08 
 
 
294 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  29.57 
 
 
304 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.9 
 
 
305 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  30.07 
 
 
310 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  28.48 
 
 
310 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  31.56 
 
 
305 aa  123  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  31.03 
 
 
295 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  33.45 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  30.54 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  28.52 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>