241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0827 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  624  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  98.06 
 
 
309 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  91.26 
 
 
309 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  90.61 
 
 
309 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  90.61 
 
 
309 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  91.26 
 
 
309 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  90.61 
 
 
309 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  91.59 
 
 
309 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  90.61 
 
 
309 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  89.97 
 
 
309 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  89.32 
 
 
309 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  88.31 
 
 
309 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  88.35 
 
 
309 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  88.64 
 
 
309 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  88.64 
 
 
309 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  88.03 
 
 
309 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  88.03 
 
 
309 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  88.31 
 
 
309 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  88.35 
 
 
312 aa  535  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  87.46 
 
 
294 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  87.12 
 
 
294 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  84.41 
 
 
294 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  76.95 
 
 
294 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  75.93 
 
 
294 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  80.07 
 
 
295 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  75.93 
 
 
294 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  75.93 
 
 
294 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  78.38 
 
 
295 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  68.49 
 
 
299 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  68.37 
 
 
295 aa  388  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  62.37 
 
 
295 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  63.36 
 
 
297 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  59.93 
 
 
293 aa  349  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  58.78 
 
 
300 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  60.62 
 
 
297 aa  347  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  58.78 
 
 
300 aa  346  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  58.02 
 
 
301 aa  343  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  57.43 
 
 
300 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  57 
 
 
303 aa  338  7e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  56.85 
 
 
290 aa  335  7e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  57.77 
 
 
305 aa  333  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  56.57 
 
 
305 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  56.8 
 
 
297 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  52.05 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  53.31 
 
 
293 aa  295  6e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  51.69 
 
 
311 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  52.86 
 
 
293 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  47.1 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  50.17 
 
 
295 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  49.83 
 
 
291 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  49.14 
 
 
294 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  45.42 
 
 
296 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  47.42 
 
 
311 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  43.34 
 
 
304 aa  215  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  41.64 
 
 
272 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.21 
 
 
289 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  41.3 
 
 
272 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  41.3 
 
 
272 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  40.27 
 
 
272 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  37.67 
 
 
282 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  36.21 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  36.58 
 
 
281 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  38.57 
 
 
273 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  34.35 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  35.08 
 
 
312 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  32.31 
 
 
273 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.55 
 
 
271 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  33.64 
 
 
310 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  34.41 
 
 
321 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  35.74 
 
 
313 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  33.44 
 
 
310 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  36.19 
 
 
310 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  33.44 
 
 
308 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  34.25 
 
 
272 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  35.17 
 
 
272 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  33.94 
 
 
309 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  32.54 
 
 
272 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  33.75 
 
 
310 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  33.02 
 
 
334 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.67 
 
 
296 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  31.63 
 
 
293 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  35.43 
 
 
287 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  32.65 
 
 
293 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  34.06 
 
 
306 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  36.39 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  32.68 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  37.54 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  34.94 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.44 
 
 
306 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  36 
 
 
299 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  32.65 
 
 
453 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  36.52 
 
 
274 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  36.52 
 
 
274 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  31.97 
 
 
311 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  34.65 
 
 
276 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  35.42 
 
 
308 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.78 
 
 
305 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  33.86 
 
 
310 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  33.96 
 
 
310 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  32.7 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>