244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1080 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  75.19 
 
 
280 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  65.07 
 
 
274 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  63.97 
 
 
274 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  59.93 
 
 
283 aa  341  5.999999999999999e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  58.63 
 
 
281 aa  333  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  58.84 
 
 
279 aa  333  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  59.27 
 
 
280 aa  332  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  60 
 
 
279 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  57.84 
 
 
277 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  56.99 
 
 
281 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  59.21 
 
 
283 aa  329  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  56.73 
 
 
277 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  57.66 
 
 
280 aa  318  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1554  protein of unknown function DUF849  58.3 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1354  hypothetical protein  58.18 
 
 
278 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.291809  normal  0.536847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  53.68 
 
 
274 aa  266  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  51.47 
 
 
274 aa  258  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  51.47 
 
 
274 aa  256  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  40 
 
 
275 aa  207  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  39.93 
 
 
293 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  39.42 
 
 
289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  38.01 
 
 
273 aa  198  7.999999999999999e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  36.76 
 
 
273 aa  198  7.999999999999999e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  40.22 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  40.22 
 
 
273 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  38.89 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  39.42 
 
 
271 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  39.44 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  36.82 
 
 
449 aa  181  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  38.29 
 
 
272 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  37.86 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  36.1 
 
 
453 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  36.13 
 
 
272 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  35.53 
 
 
272 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.77 
 
 
272 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  35.94 
 
 
276 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  35.16 
 
 
272 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  35.04 
 
 
272 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  36.2 
 
 
280 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  37.18 
 
 
280 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  34.88 
 
 
281 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  38.04 
 
 
281 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  36 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.9 
 
 
303 aa  146  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  33.11 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  30.39 
 
 
296 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  32.42 
 
 
290 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  32.65 
 
 
293 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  32.06 
 
 
290 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  32.08 
 
 
297 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  35.17 
 
 
295 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  32.77 
 
 
294 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  30.56 
 
 
292 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  33.91 
 
 
311 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  33.45 
 
 
293 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  31.4 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  30.98 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  31.76 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  33.91 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.88 
 
 
294 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  32.09 
 
 
294 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  32.99 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  31.42 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  31.03 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  29.79 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  31.03 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  32.29 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  30.9 
 
 
294 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.4 
 
 
305 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  31.65 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2814  hypothetical protein  28.82 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  32.65 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  31.53 
 
 
309 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  31.53 
 
 
309 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  31.53 
 
 
309 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  30.72 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  31.53 
 
 
309 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  32.99 
 
 
293 aa  125  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  32.53 
 
 
291 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  30.2 
 
 
295 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  31.19 
 
 
312 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  30.07 
 
 
312 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  31.46 
 
 
310 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  31.86 
 
 
309 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  31.31 
 
 
294 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  30.16 
 
 
299 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  31.53 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  31.19 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  30.03 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  29.12 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  31.53 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  30.85 
 
 
309 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  30.07 
 
 
294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  28.77 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  31.53 
 
 
295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  29.12 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  30.98 
 
 
309 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.83 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  26.91 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>