228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2814 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2814  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  598  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  60.76 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  60.07 
 
 		 294 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  60.07 
 
 		 294 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  60.07 
 
 		 294 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  61.32 
 
 		 290 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  61.54 
 
 		 288 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  60.9 
 
 		 288 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  60.55 
 
 		 288 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  62.02 
 
 		 288 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  60.78 
 
 		 294 aa  361  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  40.07 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  34.93 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  32.29 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.96 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  31.49 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  31.49 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  33.91 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  30.45 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  30.45 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  29.18 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  32.13 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  30.93 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  30.29 
 
 		 308 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  32.53 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  30.03 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  28.82 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  30.45 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  30.34 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  28.71 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  32.25 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  31.25 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  31.42 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  30.42 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  29.31 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  30.03 
 
 		 272 aa  122  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  31.6 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  30.1 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  32.03 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  30.29 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  32.9 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  32.9 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  32.9 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  32.9 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  29.84 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.37 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  32.9 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  31.62 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  31.92 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  33.22 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  31.58 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  31.58 
 
 		 294 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  30.45 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  30.69 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  32.11 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  31.08 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1554  protein of unknown function DUF849  30.21 
 
 		 278 aa  116  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.45 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  30.48 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  31.77 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  31.7 
 
 		 296 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  29.45 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  31.05 
 
 		 309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  30.58 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  32.33 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  32.57 
 
 		 309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  32.57 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  31.92 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.48 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.18 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  32.57 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  30.45 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1354  hypothetical protein  29.86 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.291809  normal  0.536847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  30.88 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  29.18 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.43 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  32.57 
 
 		 312 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  32.03 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  31.6 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  29.39 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  31.15 
 
 		 315 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  28.43 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  31.74 
 
 		 277 aa  112  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  30.1 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  30.41 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  28.77 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  30.03 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  30.42 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  30.39 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  29.14 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  29.01 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  29.37 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  30.72 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  28.62 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  31.7 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  30.38 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  29.37 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  29.61 
 
 		 295 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  32.25 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>