227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0956 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  67.74 
 
 
310 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  65.16 
 
 
310 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  65.47 
 
 
334 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  67.32 
 
 
311 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  70.16 
 
 
314 aa  434  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  64.84 
 
 
310 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  65.03 
 
 
307 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  64.52 
 
 
310 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  64.52 
 
 
310 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  64.19 
 
 
310 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  64.52 
 
 
310 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  64.19 
 
 
310 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  65.03 
 
 
321 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  68.06 
 
 
310 aa  425  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  67.43 
 
 
309 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  63.87 
 
 
310 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  66.45 
 
 
309 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  63.67 
 
 
310 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  63.87 
 
 
310 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  63.87 
 
 
310 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  63.55 
 
 
310 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  63.55 
 
 
310 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  63.55 
 
 
310 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  63.34 
 
 
310 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  64.84 
 
 
310 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  61.94 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  65.81 
 
 
309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  62.54 
 
 
308 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  63.87 
 
 
310 aa  401  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  61.29 
 
 
310 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  62.38 
 
 
309 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  63.43 
 
 
310 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  53.23 
 
 
310 aa  368  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  56.13 
 
 
310 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  61.49 
 
 
311 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  53.57 
 
 
312 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  58.5 
 
 
315 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  57.47 
 
 
312 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  54.22 
 
 
309 aa  352  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  55.52 
 
 
309 aa  348  7e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  53.55 
 
 
310 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  52.6 
 
 
310 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  55.23 
 
 
308 aa  332  7.000000000000001e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  54.25 
 
 
306 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  53.92 
 
 
306 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  52.73 
 
 
313 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  51.32 
 
 
309 aa  312  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  52.73 
 
 
311 aa  311  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  51.32 
 
 
311 aa  311  6.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  49.84 
 
 
309 aa  301  9e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  49.84 
 
 
310 aa  279  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  42.67 
 
 
326 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  42.26 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  42.26 
 
 
310 aa  231  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  34.84 
 
 
296 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  34.9 
 
 
308 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.29 
 
 
305 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  34.44 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  37.58 
 
 
272 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1933  hypothetical protein  67.44 
 
 
129 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00663582  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  33.22 
 
 
287 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.11 
 
 
289 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  35 
 
 
273 aa  157  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  36.91 
 
 
272 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  36.67 
 
 
272 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  32.89 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.33 
 
 
272 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  34.06 
 
 
301 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  33.67 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  34.45 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  33.64 
 
 
311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33 
 
 
271 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  32.7 
 
 
297 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  31.56 
 
 
304 aa  143  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  31.45 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  32.09 
 
 
294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  31.78 
 
 
293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  32.09 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  32.09 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  30.41 
 
 
293 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  32.09 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  34.17 
 
 
294 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  31.1 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  32.39 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  31.35 
 
 
292 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  29.56 
 
 
297 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  32.09 
 
 
295 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  33.02 
 
 
294 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  32.4 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  33.02 
 
 
294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  30.82 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  29.65 
 
 
296 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  30.53 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  31.03 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  29.54 
 
 
300 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  31.03 
 
 
300 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  31.79 
 
 
290 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  32.52 
 
 
309 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  32.52 
 
 
309 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>