238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2170 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  39.79 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  38.25 
 
 
289 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  36.11 
 
 
275 aa  192  6e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  34.83 
 
 
296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.76 
 
 
272 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  34.62 
 
 
287 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  37.41 
 
 
272 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  36.71 
 
 
272 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  37.41 
 
 
272 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  37.54 
 
 
273 aa  185  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  37.06 
 
 
273 aa  182  8.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  35.79 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.89 
 
 
271 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  33.98 
 
 
310 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  33.98 
 
 
310 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  33.89 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  32.68 
 
 
311 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  32.99 
 
 
316 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.47 
 
 
280 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  33.68 
 
 
321 aa  158  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  33.77 
 
 
306 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  32.34 
 
 
310 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  32.06 
 
 
281 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  32.12 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.12 
 
 
306 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  34.02 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  32.99 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  32.51 
 
 
272 aa  152  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.84 
 
 
303 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  30.59 
 
 
293 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  33.92 
 
 
281 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  31.8 
 
 
292 aa  148  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  33.77 
 
 
313 aa  148  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  34.11 
 
 
304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  32.89 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  32.17 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  34.02 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2814  hypothetical protein  32.53 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  34.02 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  31.03 
 
 
288 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  35.86 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  34.65 
 
 
309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  32.07 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  34.32 
 
 
309 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  33 
 
 
310 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  30.8 
 
 
293 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  30.77 
 
 
274 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.53 
 
 
305 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  33.01 
 
 
296 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  33.98 
 
 
309 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  33.68 
 
 
280 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  33.66 
 
 
303 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  33.55 
 
 
309 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  33.55 
 
 
311 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  30.07 
 
 
274 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  32.89 
 
 
321 aa  142  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  31.35 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  31.79 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  30.16 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  32.62 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  32.99 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  30.26 
 
 
310 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  31.47 
 
 
279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  32.8 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  32.75 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  32.62 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  30.69 
 
 
281 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  33.57 
 
 
274 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  30.56 
 
 
310 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  31.03 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  30.77 
 
 
280 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  32.78 
 
 
310 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  32.52 
 
 
281 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  31.94 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  31.89 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  31.1 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  30.39 
 
 
297 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  32.35 
 
 
310 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  31.33 
 
 
301 aa  136  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  33.44 
 
 
308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  31.46 
 
 
310 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  28.43 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  34.21 
 
 
315 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  33.22 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  32.78 
 
 
307 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  30.18 
 
 
283 aa  132  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  132  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  30.46 
 
 
334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.79 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  30.82 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  30.82 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  28.52 
 
 
277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  32.01 
 
 
314 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  30.69 
 
 
294 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  29.08 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  32.47 
 
 
294 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  32.24 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  30.82 
 
 
310 aa  128  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>