240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3578 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  91.94 
 
 		 310 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  74.84 
 
 		 309 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  64.63 
 
 		 310 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  63.67 
 
 		 310 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  64.31 
 
 		 310 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  68.57 
 
 		 314 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  67.32 
 
 		 307 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  64.38 
 
 		 310 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  67.65 
 
 		 309 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  67.65 
 
 		 309 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  64.38 
 
 		 310 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  63.4 
 
 		 321 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  64.05 
 
 		 310 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  64.05 
 
 		 310 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  68.81 
 
 		 310 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  63.73 
 
 		 310 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  63.73 
 
 		 310 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  65.03 
 
 		 308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  69.51 
 
 		 310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  63.02 
 
 		 310 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  63.02 
 
 		 310 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  63.02 
 
 		 310 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  62.7 
 
 		 310 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  64.63 
 
 		 310 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  60.77 
 
 		 310 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  62.06 
 
 		 310 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  62.06 
 
 		 310 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  59.74 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  63.07 
 
 		 310 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  62.06 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  60.06 
 
 		 311 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  63.21 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  54.34 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  58.33 
 
 		 311 aa  353  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  55.63 
 
 		 310 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  55.48 
 
 		 310 aa  349  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  58.96 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  58.31 
 
 		 312 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  56.17 
 
 		 308 aa  342  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  51.13 
 
 		 312 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  55.88 
 
 		 310 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  55.74 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  55.74 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  53.23 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  53.55 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  55.56 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  55.23 
 
 		 306 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  52.75 
 
 		 313 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  54.07 
 
 		 309 aa  308  9e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  53.21 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  54.17 
 
 		 310 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  43.32 
 
 		 326 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  43.37 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  43.69 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  40.94 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  33.99 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.96 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  33.75 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  39.6 
 
 		 272 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  39.93 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  34.56 
 
 		 273 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  37.58 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.79 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  39.26 
 
 		 272 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.12 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  32.55 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  33.54 
 
 		 297 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  34.78 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  33.23 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  31.49 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  33.89 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  35.31 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  31.11 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1933  hypothetical protein  64.06 
 
 		 129 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00663582  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  33.96 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  32.39 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  33.65 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  32.81 
 
 		 294 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  32.5 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  32.5 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  33.85 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  32.5 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  33.85 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  30.5 
 
 		 297 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  34.22 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  34.17 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  33.23 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  34.17 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  35.69 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  32.92 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  33.75 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  32.7 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.54 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  31.66 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  34.17 
 
 		 309 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  34.17 
 
 		 309 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  34.17 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>