237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0977 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  100 
 
 
310 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  75.65 
 
 
312 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  63.31 
 
 
310 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  65.03 
 
 
308 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  64.19 
 
 
309 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  64.5 
 
 
312 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  61.36 
 
 
310 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  61.61 
 
 
313 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  59.74 
 
 
310 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  62.21 
 
 
310 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  61.89 
 
 
310 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  61.56 
 
 
310 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  61.04 
 
 
315 aa  381  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  61.24 
 
 
310 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  61.89 
 
 
310 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  61.24 
 
 
310 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  62.54 
 
 
310 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  62.21 
 
 
310 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  62.54 
 
 
310 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  62.54 
 
 
310 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  61.56 
 
 
310 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  61.29 
 
 
309 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  60.19 
 
 
308 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  60.78 
 
 
310 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  61.56 
 
 
310 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  58.03 
 
 
310 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  60.26 
 
 
314 aa  368  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  59.15 
 
 
307 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  59.68 
 
 
309 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  58.39 
 
 
309 aa  360  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  56.21 
 
 
334 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  57.42 
 
 
310 aa  359  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  55.84 
 
 
321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  57.42 
 
 
309 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  58.03 
 
 
311 aa  352  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  57.98 
 
 
310 aa  351  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  58.25 
 
 
311 aa  351  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  55.23 
 
 
311 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  55.48 
 
 
310 aa  349  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  56.82 
 
 
310 aa  348  9e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  58 
 
 
309 aa  346  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  52.6 
 
 
310 aa  346  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  58.44 
 
 
310 aa  346  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  58.77 
 
 
310 aa  345  7e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  56.49 
 
 
310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  55.48 
 
 
309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  57.93 
 
 
306 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  57.65 
 
 
306 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  59.61 
 
 
310 aa  332  6e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  55.05 
 
 
309 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  52.98 
 
 
310 aa  297  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  51.16 
 
 
311 aa  296  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  47.06 
 
 
326 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  48.87 
 
 
310 aa  271  8.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  47.9 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5538  hypothetical protein  79.03 
 
 
128 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.66 
 
 
305 aa  188  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  37.07 
 
 
293 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  37.12 
 
 
273 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  35.86 
 
 
296 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  36.25 
 
 
297 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  35.31 
 
 
297 aa  175  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.33 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  35.14 
 
 
308 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  36.12 
 
 
272 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  35.43 
 
 
272 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  33.02 
 
 
294 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  33.02 
 
 
294 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  33.02 
 
 
294 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  32.71 
 
 
294 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  35.62 
 
 
295 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  35.5 
 
 
321 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.43 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  34.21 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  33.54 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  34.06 
 
 
298 aa  163  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  35.12 
 
 
272 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  32.29 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.22 
 
 
271 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  33.96 
 
 
292 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  31.35 
 
 
290 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  35 
 
 
293 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  34.06 
 
 
296 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  34.89 
 
 
294 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  36.02 
 
 
295 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  34.49 
 
 
304 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  36.02 
 
 
299 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  32.13 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  34.38 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  33.02 
 
 
300 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  34.58 
 
 
294 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  34.58 
 
 
294 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  33.75 
 
 
309 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  33.75 
 
 
309 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  33.12 
 
 
309 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  32.4 
 
 
303 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  32.44 
 
 
272 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  33.44 
 
 
309 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  33.44 
 
 
309 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  33.44 
 
 
309 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>