232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2778 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  77.3 
 
 
321 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  71.43 
 
 
310 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  74.75 
 
 
307 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  72.04 
 
 
310 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  76.47 
 
 
309 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  76.7 
 
 
309 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  75.49 
 
 
309 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  72.82 
 
 
310 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  70.16 
 
 
310 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  72.82 
 
 
310 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  72.49 
 
 
310 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  72.82 
 
 
310 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  72.49 
 
 
310 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  72.82 
 
 
310 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  72.49 
 
 
310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  72.82 
 
 
310 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  72.82 
 
 
310 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  72.82 
 
 
310 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  72.49 
 
 
310 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  72.49 
 
 
310 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  76.14 
 
 
310 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  69.84 
 
 
310 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  68.57 
 
 
310 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  66.77 
 
 
334 aa  431  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  68.39 
 
 
310 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  69.93 
 
 
310 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  66.67 
 
 
308 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  62.21 
 
 
310 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  68.85 
 
 
310 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  66.01 
 
 
310 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  67.21 
 
 
311 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  67.22 
 
 
309 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  70 
 
 
310 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  64.76 
 
 
315 aa  401  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  64.38 
 
 
312 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  58.31 
 
 
312 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  62.75 
 
 
308 aa  384  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  61.11 
 
 
310 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  60.98 
 
 
310 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  65 
 
 
311 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  60.26 
 
 
309 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  59.93 
 
 
309 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  60.26 
 
 
310 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  60.38 
 
 
313 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  60.59 
 
 
311 aa  358  5e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  60.53 
 
 
309 aa  358  6e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  60.53 
 
 
311 aa  358  8e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  59.48 
 
 
306 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  59.48 
 
 
306 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  56.03 
 
 
309 aa  344  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  59.8 
 
 
310 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  45.75 
 
 
326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  45.63 
 
 
310 aa  251  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  45.31 
 
 
310 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.66 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  38.03 
 
 
305 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  36.18 
 
 
296 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  39.73 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  35.85 
 
 
293 aa  182  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  35.57 
 
 
287 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  35.31 
 
 
275 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  35.65 
 
 
297 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  35.91 
 
 
273 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  34.38 
 
 
292 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  37.42 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  34.38 
 
 
297 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  35.24 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  34.7 
 
 
297 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  38.24 
 
 
294 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.33 
 
 
271 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  34.81 
 
 
294 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  34.78 
 
 
273 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  35.23 
 
 
272 aa  166  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  34.18 
 
 
294 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  34.18 
 
 
294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  34.18 
 
 
294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  35.96 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  35.83 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  37.12 
 
 
311 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1933  hypothetical protein  68.55 
 
 
129 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00663582  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  36.91 
 
 
272 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.91 
 
 
272 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  35.33 
 
 
311 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  36.91 
 
 
272 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  34.89 
 
 
300 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  34.89 
 
 
300 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  34.6 
 
 
295 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  35.76 
 
 
293 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  31.65 
 
 
290 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  36.58 
 
 
272 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  34.17 
 
 
301 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  35.02 
 
 
294 aa  155  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  35 
 
 
273 aa  155  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  32.18 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  36.31 
 
 
295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  33.97 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  34.1 
 
 
321 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  34.38 
 
 
294 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>