229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6069 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  70.16 
 
 
310 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  70.39 
 
 
310 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  74.75 
 
 
314 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  70.49 
 
 
321 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  70.16 
 
 
310 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  70.16 
 
 
310 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  75.49 
 
 
310 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  70.16 
 
 
310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  65.03 
 
 
310 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  69.51 
 
 
310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  69.51 
 
 
310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  71.48 
 
 
310 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  71.48 
 
 
310 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  69.84 
 
 
310 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  71.48 
 
 
310 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  71.15 
 
 
310 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  71.15 
 
 
310 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  71.15 
 
 
310 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  71.48 
 
 
309 aa  434  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  70.82 
 
 
309 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  65.57 
 
 
308 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  67.32 
 
 
310 aa  418  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  63.4 
 
 
334 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  67.21 
 
 
310 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  69.51 
 
 
309 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  67.65 
 
 
310 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  63.73 
 
 
311 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  64.8 
 
 
310 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  64.38 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  65.03 
 
 
310 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  63.07 
 
 
309 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  59.02 
 
 
310 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  63.88 
 
 
310 aa  381  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  61.31 
 
 
310 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  56.21 
 
 
312 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  61.44 
 
 
315 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  59.15 
 
 
310 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  60.13 
 
 
309 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  60.26 
 
 
312 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  57.65 
 
 
310 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  56.35 
 
 
309 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  59.21 
 
 
309 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  57.79 
 
 
308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  59.21 
 
 
311 aa  352  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  57.57 
 
 
311 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  57.33 
 
 
313 aa  338  5e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  56.68 
 
 
306 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  56.35 
 
 
306 aa  335  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  56.54 
 
 
311 aa  331  7.000000000000001e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  54.25 
 
 
309 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  53.27 
 
 
310 aa  292  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  44.77 
 
 
326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  45.02 
 
 
310 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  45.02 
 
 
310 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  37.88 
 
 
308 aa  178  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.74 
 
 
305 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  33.56 
 
 
287 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  33.33 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1933  hypothetical protein  68 
 
 
129 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00663582  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.22 
 
 
289 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  34.9 
 
 
272 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  35.23 
 
 
272 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  34.75 
 
 
273 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  32.91 
 
 
292 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  32.18 
 
 
293 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  34.29 
 
 
304 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  33.23 
 
 
297 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  32.91 
 
 
294 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  32.91 
 
 
294 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  32.91 
 
 
294 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  35.65 
 
 
297 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  34.46 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.23 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  32.91 
 
 
294 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  32.49 
 
 
301 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  32.39 
 
 
298 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  30.79 
 
 
297 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  33.22 
 
 
275 aa  149  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.55 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  32.81 
 
 
300 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  32.7 
 
 
295 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  33.02 
 
 
293 aa  143  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  34.11 
 
 
321 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.18 
 
 
294 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  32.33 
 
 
272 aa  142  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  32.06 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  32.81 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  32.49 
 
 
294 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  31.65 
 
 
300 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  32.39 
 
 
309 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  33.02 
 
 
295 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  31.33 
 
 
300 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  32.39 
 
 
309 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  32.81 
 
 
312 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  32.08 
 
 
309 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  33.54 
 
 
291 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  32.08 
 
 
309 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  32.08 
 
 
309 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>