232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3749 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  99.68 
 
 		 310 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  98.06 
 
 		 310 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  97.42 
 
 		 310 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  97.42 
 
 		 310 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  96.13 
 
 		 310 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  89.35 
 
 		 310 aa  550  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  89.35 
 
 		 310 aa  550  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  89.35 
 
 		 310 aa  550  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  89.03 
 
 		 310 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  88.39 
 
 		 310 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  88.39 
 
 		 310 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  80.65 
 
 		 310 aa  534  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  72.58 
 
 		 310 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  72.49 
 
 		 314 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  68.06 
 
 		 310 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  69.51 
 
 		 307 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  64.52 
 
 		 310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  72.9 
 
 		 310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  67.99 
 
 		 321 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  69.71 
 
 		 309 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  69.71 
 
 		 309 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  66.56 
 
 		 334 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  67.43 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  66.89 
 
 		 311 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  65.48 
 
 		 310 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  66.45 
 
 		 310 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  66.13 
 
 		 310 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  65.9 
 
 		 309 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  64.84 
 
 		 309 aa  411  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  63.73 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  59.35 
 
 		 310 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  62.09 
 
 		 310 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  66.56 
 
 		 311 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  63.52 
 
 		 315 aa  384  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  59.68 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  59.61 
 
 		 312 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  61.84 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  61.89 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  60.32 
 
 		 310 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  59.74 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  61.44 
 
 		 312 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  60.78 
 
 		 306 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  60.13 
 
 		 306 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  58.44 
 
 		 309 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  58.82 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  56.91 
 
 		 309 aa  345  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  56.91 
 
 		 311 aa  345  5e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  58.2 
 
 		 311 aa  345  7e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  58.12 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  54.4 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  56.27 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  46.67 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  46.28 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  45.95 
 
 		 310 aa  248  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  41.55 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.69 
 
 		 305 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1933  hypothetical protein  72.09 
 
 		 129 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00663582  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  34.56 
 
 		 273 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  37.67 
 
 		 272 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  35.85 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  37.67 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.33 
 
 		 272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  33.11 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  38 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  32.46 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  35.71 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  33.44 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  34.11 
 
 		 321 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.22 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  33.02 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  34.9 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  33.75 
 
 		 297 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  31.55 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  34.07 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  32.28 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  31.45 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  32.6 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  31.96 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  34.98 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  31.96 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  31.55 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  33.97 
 
 		 295 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  31.65 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33 
 
 		 271 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  33.65 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5538  hypothetical protein  59.52 
 
 		 128 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  31.1 
 
 		 273 aa  142  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  32.81 
 
 		 294 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  32.81 
 
 		 294 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  32.18 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  29.97 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  31.21 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  32.49 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  32.49 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  32.49 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  33.97 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  32.49 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  32.61 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.6 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>