233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4704 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  79.15 
 
 
308 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  74.18 
 
 
334 aa  471  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  74.52 
 
 
310 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  74.59 
 
 
309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  74.59 
 
 
309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  72.7 
 
 
309 aa  448  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  67.74 
 
 
310 aa  447  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  72.55 
 
 
311 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  68.08 
 
 
321 aa  434  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  64.84 
 
 
310 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  66.13 
 
 
310 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  67.42 
 
 
310 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  67.42 
 
 
310 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  67.1 
 
 
310 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  67.1 
 
 
310 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  69.03 
 
 
310 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  69.03 
 
 
310 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  69.03 
 
 
310 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  66.45 
 
 
310 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  68.71 
 
 
310 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  68.71 
 
 
310 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  69.03 
 
 
310 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  66.45 
 
 
310 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  68.63 
 
 
314 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  65.03 
 
 
307 aa  407  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  68.71 
 
 
309 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  64.31 
 
 
310 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  64.52 
 
 
310 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  64.63 
 
 
310 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  57.42 
 
 
310 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  66.77 
 
 
310 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  63.23 
 
 
310 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  57.74 
 
 
310 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  60 
 
 
312 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  63.49 
 
 
310 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  55.99 
 
 
312 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  57.47 
 
 
309 aa  358  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  61.15 
 
 
311 aa  355  6.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  55.16 
 
 
310 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  58.17 
 
 
308 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  59.68 
 
 
315 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  56.82 
 
 
310 aa  352  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  57.79 
 
 
309 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  59.81 
 
 
311 aa  344  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  56.31 
 
 
311 aa  341  9e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  56.58 
 
 
309 aa  338  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  55.52 
 
 
313 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  53.27 
 
 
306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  52.61 
 
 
306 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  58.52 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  54.4 
 
 
309 aa  311  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  45.28 
 
 
326 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  43.87 
 
 
310 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  43.55 
 
 
310 aa  238  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  37.21 
 
 
273 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  36.81 
 
 
296 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.04 
 
 
305 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  36.16 
 
 
287 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  39.33 
 
 
308 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  36.16 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  36.36 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  33.75 
 
 
292 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.1 
 
 
289 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  38.67 
 
 
272 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  33.96 
 
 
297 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  34.77 
 
 
301 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  37.33 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  36.05 
 
 
304 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  34.45 
 
 
273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.33 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  37.33 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  35.64 
 
 
321 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  34.21 
 
 
275 aa  162  9e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  34.45 
 
 
272 aa  159  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  34.27 
 
 
295 aa  159  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  33.64 
 
 
294 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  33.64 
 
 
294 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  33.64 
 
 
294 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  34.8 
 
 
296 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  34.69 
 
 
293 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1933  hypothetical protein  69.77 
 
 
129 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00663582  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  32.18 
 
 
297 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.79 
 
 
271 aa  155  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  35.51 
 
 
295 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  35.09 
 
 
300 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  35.2 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  34.47 
 
 
311 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  35.83 
 
 
309 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  35.51 
 
 
309 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  35.51 
 
 
309 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  33 
 
 
273 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  35.51 
 
 
312 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  35.51 
 
 
309 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  35.51 
 
 
309 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  35.2 
 
 
309 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  35.2 
 
 
309 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  35.42 
 
 
294 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  35.2 
 
 
309 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>