230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2597 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  100 
 
 
310 aa  638    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  72.9 
 
 
310 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  74.19 
 
 
310 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  74.43 
 
 
310 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  72.9 
 
 
310 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  72.9 
 
 
310 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  72.58 
 
 
310 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  72.9 
 
 
310 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  72.58 
 
 
310 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  74.84 
 
 
310 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  74.84 
 
 
310 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  74.84 
 
 
310 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  74.52 
 
 
310 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  73.87 
 
 
310 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  73.87 
 
 
310 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  63.87 
 
 
310 aa  427  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  67.21 
 
 
307 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  69.93 
 
 
314 aa  424  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  64.8 
 
 
310 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  70.68 
 
 
309 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  67.74 
 
 
310 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  69.71 
 
 
309 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  67.75 
 
 
308 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  66.13 
 
 
310 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  63.37 
 
 
321 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  63.61 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  63.4 
 
 
310 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  63.07 
 
 
310 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  63.82 
 
 
309 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  64.8 
 
 
310 aa  388  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  63.28 
 
 
311 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  66.77 
 
 
310 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  63.55 
 
 
309 aa  381  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  55.27 
 
 
310 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  57.98 
 
 
312 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  59.93 
 
 
315 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  61.72 
 
 
311 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  56.59 
 
 
310 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  58.77 
 
 
310 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  58.17 
 
 
312 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  56.17 
 
 
309 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  55.19 
 
 
309 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  54.84 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  55.23 
 
 
308 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  56.59 
 
 
311 aa  324  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  53.29 
 
 
309 aa  322  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  56.21 
 
 
306 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  52.73 
 
 
311 aa  322  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  55.56 
 
 
306 aa  322  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  54.55 
 
 
313 aa  317  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  53.42 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  52.73 
 
 
310 aa  285  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  45.42 
 
 
326 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  46.28 
 
 
310 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  46.28 
 
 
310 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  40.61 
 
 
308 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  36 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.09 
 
 
289 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  38.41 
 
 
272 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  38.08 
 
 
272 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  34.55 
 
 
296 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1933  hypothetical protein  68.99 
 
 
129 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00663582  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  38.41 
 
 
272 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  38.33 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  35.43 
 
 
275 aa  163  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  35.12 
 
 
273 aa  162  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  33.96 
 
 
293 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.19 
 
 
305 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  34.16 
 
 
301 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  33.96 
 
 
292 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.45 
 
 
271 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  32.46 
 
 
287 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  34.07 
 
 
297 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  34.89 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  34.38 
 
 
304 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  33.12 
 
 
297 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.42 
 
 
294 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  33.02 
 
 
297 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  33.44 
 
 
293 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  33.89 
 
 
272 aa  146  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  32.55 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  33.12 
 
 
295 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  29.43 
 
 
290 aa  142  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  31.45 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  31.45 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  31.45 
 
 
294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  33.12 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  34.88 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  35.87 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  33.23 
 
 
311 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  29.97 
 
 
298 aa  139  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  33.75 
 
 
295 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  31.45 
 
 
294 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  34.33 
 
 
272 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  32.59 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  31.78 
 
 
300 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  32.81 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  32.81 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  32.81 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  32.81 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>