244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1068 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  54.24 
 
 
273 aa  300  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  55.02 
 
 
289 aa  298  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  54.95 
 
 
272 aa  293  2e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  52.38 
 
 
275 aa  292  3e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  51.28 
 
 
273 aa  292  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  55.72 
 
 
271 aa  288  7e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  48.71 
 
 
272 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  48.71 
 
 
272 aa  258  9e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  48.34 
 
 
272 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  48.34 
 
 
272 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  43.91 
 
 
274 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  42.59 
 
 
274 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  38.01 
 
 
281 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  38.49 
 
 
287 aa  198  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  39.34 
 
 
280 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  39.05 
 
 
281 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  39.79 
 
 
290 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  37.87 
 
 
326 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  36.5 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  39.64 
 
 
277 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  40.44 
 
 
280 aa  186  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  37.23 
 
 
272 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  38.89 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  36 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  37.63 
 
 
296 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  37.72 
 
 
280 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  38.89 
 
 
279 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  37.86 
 
 
281 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  35.74 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  39.11 
 
 
281 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  38.62 
 
 
311 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  33.79 
 
 
301 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  36 
 
 
293 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  35.05 
 
 
321 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  35.32 
 
 
272 aa  176  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  37.72 
 
 
279 aa  175  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  34.95 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  34.95 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  38.24 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  38.83 
 
 
280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  38.89 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  38.13 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  36.33 
 
 
304 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  36.19 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  35.69 
 
 
294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  35.05 
 
 
294 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  39.64 
 
 
280 aa  171  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  34.18 
 
 
449 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  37.17 
 
 
310 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  35.99 
 
 
293 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  39.86 
 
 
274 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  34.71 
 
 
294 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  37.5 
 
 
310 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.3 
 
 
305 aa  168  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  33.22 
 
 
294 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  35.29 
 
 
295 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  39.64 
 
 
274 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  39.86 
 
 
274 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.5 
 
 
294 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  37.37 
 
 
311 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  34.92 
 
 
309 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  34.92 
 
 
309 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  34.92 
 
 
309 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  34.24 
 
 
295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  34.92 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  34.92 
 
 
309 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  33.22 
 
 
292 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37 
 
 
303 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  35.76 
 
 
296 aa  165  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  34.92 
 
 
309 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.52 
 
 
305 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  37.97 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  34.42 
 
 
453 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  34.24 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  34.24 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  34.92 
 
 
309 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  34.02 
 
 
295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  34.92 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  34.36 
 
 
312 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  36.24 
 
 
295 aa  161  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  35.79 
 
 
316 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  34.71 
 
 
309 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  34.71 
 
 
309 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  34.36 
 
 
309 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  33.33 
 
 
299 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  34.36 
 
 
309 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  34.36 
 
 
309 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  32.76 
 
 
290 aa  159  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  33.56 
 
 
306 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  34.36 
 
 
309 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  34.83 
 
 
294 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  34.36 
 
 
309 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  34.78 
 
 
310 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  36.46 
 
 
291 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  34.83 
 
 
294 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  34.36 
 
 
309 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  35.23 
 
 
334 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  35 
 
 
310 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  36.64 
 
 
299 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>