231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3015 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  100 
 
 		 306 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  99.02 
 
 		 306 aa  624  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  66.34 
 
 		 310 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  65.47 
 
 		 310 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  56.86 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  60.13 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  59.8 
 
 		 310 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  59.8 
 
 		 310 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  59.8 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  59.8 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  58.5 
 
 		 310 aa  358  7e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  56.58 
 
 		 310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  55.7 
 
 		 312 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  59.48 
 
 		 314 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  59.67 
 
 		 310 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  52.94 
 
 		 310 aa  346  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  59.09 
 
 		 308 aa  346  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  57.98 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  59.48 
 
 		 310 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  59.48 
 
 		 310 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  59.48 
 
 		 310 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  59.15 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  59.15 
 
 		 310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  59.15 
 
 		 310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  55.45 
 
 		 321 aa  342  4e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  53.92 
 
 		 310 aa  341  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  57.65 
 
 		 310 aa  341  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  54.37 
 
 		 334 aa  338  9e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  56.35 
 
 		 307 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  57.84 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  58.17 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  59.55 
 
 		 312 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  54.55 
 
 		 311 aa  329  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  56.91 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  59.8 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  56.35 
 
 		 311 aa  325  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  56.68 
 
 		 315 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  55.23 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  56.21 
 
 		 310 aa  322  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  55.37 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  55.37 
 
 		 313 aa  318  7.999999999999999e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  56.21 
 
 		 310 aa  315  7e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  54.61 
 
 		 309 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  54.61 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  55.56 
 
 		 309 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  53.59 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  52.61 
 
 		 310 aa  308  6.999999999999999e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  52.13 
 
 		 309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  52.29 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  54.1 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  52.46 
 
 		 310 aa  295  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  50.33 
 
 		 311 aa  278  8e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  44.81 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  43.73 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  43.73 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.13 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  39.32 
 
 		 321 aa  185  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  35.67 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  36.45 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.33 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  38.05 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  34.67 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  38.38 
 
 		 272 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  38.05 
 
 		 272 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  36.09 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  33.44 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  32.89 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  35.35 
 
 		 272 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  37.46 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  36.03 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  34.81 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  35.69 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.33 
 
 		 271 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  37.14 
 
 		 311 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  38.54 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  34.49 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  34.71 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  32.44 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  33.97 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  33.44 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  35.6 
 
 		 311 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  30.25 
 
 		 297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  30.79 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  36.83 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  33.65 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  33.65 
 
 		 294 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  33.64 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  33.64 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  35.25 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  33.97 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  33.64 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  33.96 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  32.06 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  34.37 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  34.37 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  33.64 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  33.96 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  33.12 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  34.38 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>