245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0229 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  100 
 
 
293 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  87.76 
 
 
311 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  80.55 
 
 
295 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  52.4 
 
 
292 aa  318  9e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  51.72 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  51.38 
 
 
297 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  52.58 
 
 
290 aa  305  6e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  55.02 
 
 
294 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  54.36 
 
 
296 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  53.87 
 
 
294 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  54.48 
 
 
291 aa  299  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  53.2 
 
 
294 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  53.54 
 
 
294 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  52.23 
 
 
293 aa  297  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  53.2 
 
 
294 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  53.45 
 
 
304 aa  295  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  53.98 
 
 
311 aa  292  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  54.21 
 
 
295 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  54.55 
 
 
309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  53.87 
 
 
309 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  53.87 
 
 
309 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  53.87 
 
 
309 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  53.87 
 
 
309 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  53.87 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  53.87 
 
 
309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  52.36 
 
 
294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  52.7 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  52.7 
 
 
295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  53.04 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  52.86 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  52.03 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  52.53 
 
 
309 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  52.19 
 
 
309 aa  279  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  47.24 
 
 
298 aa  279  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  52.36 
 
 
309 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  52.36 
 
 
309 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  52.03 
 
 
309 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  52.03 
 
 
309 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  52.03 
 
 
309 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  52.03 
 
 
309 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  52.03 
 
 
309 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  50 
 
 
293 aa  276  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  52.03 
 
 
312 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  51.03 
 
 
299 aa  275  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  52.03 
 
 
294 aa  275  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  51.71 
 
 
295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  51.17 
 
 
305 aa  266  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  47.12 
 
 
297 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  48.99 
 
 
301 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  49.16 
 
 
300 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  47.81 
 
 
303 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  48.99 
 
 
300 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  47.65 
 
 
300 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  48.15 
 
 
305 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  36.59 
 
 
275 aa  193  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  40 
 
 
272 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  40 
 
 
272 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  37.93 
 
 
273 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  37.11 
 
 
281 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  39.66 
 
 
272 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  40.35 
 
 
272 aa  185  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  37.33 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  35.42 
 
 
273 aa  183  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  35.99 
 
 
273 aa  182  8.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  35.11 
 
 
312 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  36.16 
 
 
310 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  37.8 
 
 
272 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  33.02 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  37.03 
 
 
326 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  38.1 
 
 
306 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  34.28 
 
 
334 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  38.68 
 
 
272 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.03 
 
 
289 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  34.91 
 
 
311 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  35.33 
 
 
310 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.46 
 
 
306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  36.05 
 
 
313 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  35.85 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  35.85 
 
 
310 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  37.11 
 
 
308 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  36.79 
 
 
287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  35.53 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  35.53 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  36.61 
 
 
321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.42 
 
 
271 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  35.53 
 
 
310 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  36.36 
 
 
309 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  35.22 
 
 
310 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  36.19 
 
 
310 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  36.19 
 
 
310 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  37.88 
 
 
274 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  36.28 
 
 
310 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  36.16 
 
 
309 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  36.28 
 
 
310 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  36.28 
 
 
310 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  35.96 
 
 
310 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  37.88 
 
 
274 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  33.45 
 
 
272 aa  157  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  38.23 
 
 
274 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  35.02 
 
 
315 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>