229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0103 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  68.71 
 
 		 310 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  70.36 
 
 		 308 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  69.48 
 
 		 313 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  64.08 
 
 		 310 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  64.5 
 
 		 310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  63.78 
 
 		 309 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  65.71 
 
 		 311 aa  404  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  61.66 
 
 		 312 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  65.8 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  66.56 
 
 		 309 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  62.06 
 
 		 321 aa  388  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  65.36 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  64.38 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  64.71 
 
 		 309 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  63.23 
 
 		 310 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  60.78 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  62.9 
 
 		 311 aa  378  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  62.26 
 
 		 310 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  63.23 
 
 		 315 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  58.33 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  62.75 
 
 		 310 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  62.09 
 
 		 310 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  61.76 
 
 		 310 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  62.09 
 
 		 310 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  61.44 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  61.44 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  60.26 
 
 		 307 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  60.2 
 
 		 309 aa  364  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  60.78 
 
 		 308 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  57.47 
 
 		 310 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  60 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  59.93 
 
 		 309 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  62.09 
 
 		 310 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  62.09 
 
 		 310 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  57.05 
 
 		 311 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  62.09 
 
 		 310 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  59.87 
 
 		 310 aa  358  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  61.76 
 
 		 310 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  61.11 
 
 		 310 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  61.11 
 
 		 310 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  62.26 
 
 		 310 aa  351  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  59.87 
 
 		 310 aa  350  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  58.25 
 
 		 310 aa  345  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  58.31 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  58.17 
 
 		 310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  56.49 
 
 		 310 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  57.79 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  59.87 
 
 		 306 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  59.55 
 
 		 306 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  55.26 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  53.64 
 
 		 311 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  47.73 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  45.69 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  45.69 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  37.74 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  37 
 
 		 273 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  39.03 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  35.41 
 
 		 287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.6 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  35.41 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  37.42 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  36.75 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  35.83 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  37.38 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.09 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  36.75 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  34.7 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  35.53 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  34.77 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  34.91 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.63 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  36.93 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  34 
 
 		 273 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  35 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  34.33 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  34.38 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  34.38 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  34.38 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  32.61 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  34.17 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  33.23 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  35.76 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  30.5 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  36.42 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5538  hypothetical protein  62.99 
 
 		 128 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  33.64 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  35.22 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  36.67 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  33.86 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.7 
 
 		 294 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  34.17 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  28.93 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  33.86 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  33.13 
 
 		 311 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  33.23 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  33.23 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  33.23 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  33.23 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>