234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3969 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  79.87 
 
 
321 aa  491  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  70.39 
 
 
307 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  65.16 
 
 
310 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  66.13 
 
 
310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  72.04 
 
 
314 aa  441  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  69.68 
 
 
310 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  71.38 
 
 
309 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  69.35 
 
 
310 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  69.03 
 
 
310 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  69.03 
 
 
310 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  69.35 
 
 
310 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  69.35 
 
 
310 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  69.03 
 
 
310 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  69.35 
 
 
310 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  68.71 
 
 
310 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  68.06 
 
 
310 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  70.72 
 
 
309 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  68.06 
 
 
310 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  68.71 
 
 
310 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  66.56 
 
 
334 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  64.63 
 
 
310 aa  417  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  64.95 
 
 
310 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  68.06 
 
 
309 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  64.19 
 
 
310 aa  411  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  65.59 
 
 
311 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  65.46 
 
 
308 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  66.13 
 
 
310 aa  408  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  65.16 
 
 
310 aa  408  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  63.23 
 
 
310 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  64.08 
 
 
312 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  62.91 
 
 
309 aa  391  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  64.8 
 
 
310 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  64.14 
 
 
310 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  59.35 
 
 
310 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  56.45 
 
 
310 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  55.02 
 
 
312 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  62.3 
 
 
315 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  58.69 
 
 
309 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  58.71 
 
 
310 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  60.67 
 
 
311 aa  364  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  58.03 
 
 
310 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  57.65 
 
 
309 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  57.56 
 
 
308 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  56.82 
 
 
309 aa  346  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  56.45 
 
 
309 aa  342  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  55.84 
 
 
311 aa  338  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  56.58 
 
 
306 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  56.25 
 
 
306 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  57.23 
 
 
311 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  56.03 
 
 
313 aa  333  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  56.59 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  44.59 
 
 
326 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  42.26 
 
 
310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  42.26 
 
 
310 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  40.47 
 
 
308 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  35.97 
 
 
296 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  38.89 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  33.22 
 
 
287 aa  165  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  34.38 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  34.39 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  35.79 
 
 
272 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  33.86 
 
 
304 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  34.11 
 
 
273 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  35.45 
 
 
272 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.11 
 
 
289 aa  155  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  36.12 
 
 
272 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.79 
 
 
272 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  34.18 
 
 
296 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.35 
 
 
294 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  33.67 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  32.38 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1933  hypothetical protein  60.63 
 
 
129 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00663582  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  31.21 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  30.48 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  32.59 
 
 
294 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  31.96 
 
 
294 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  31.33 
 
 
273 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  31.96 
 
 
294 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  31.33 
 
 
294 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.67 
 
 
271 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  32.11 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  33.54 
 
 
294 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  32.38 
 
 
295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  31.21 
 
 
297 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  31.75 
 
 
295 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  32.28 
 
 
300 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  32.06 
 
 
293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  34.08 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  33.54 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  33.23 
 
 
294 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  31.1 
 
 
273 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  31.97 
 
 
295 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  31.55 
 
 
293 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  33.23 
 
 
311 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  32.28 
 
 
301 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  33.12 
 
 
291 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  31.96 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  31.96 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>