242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6173 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  98.98 
 
 
294 aa  591  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  91.5 
 
 
294 aa  528  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  82.31 
 
 
294 aa  507  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  81.97 
 
 
294 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  81.63 
 
 
294 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  80.95 
 
 
294 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  87.46 
 
 
309 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  87.12 
 
 
309 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  85.08 
 
 
309 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  84.75 
 
 
309 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  81.29 
 
 
295 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  84.07 
 
 
309 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  84.07 
 
 
309 aa  481  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  84.07 
 
 
309 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  84.07 
 
 
309 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  84.07 
 
 
309 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  83.05 
 
 
309 aa  477  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  84.07 
 
 
309 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  82.71 
 
 
309 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  83.05 
 
 
309 aa  477  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  83.05 
 
 
309 aa  477  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  84.07 
 
 
309 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  82.71 
 
 
309 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  83.73 
 
 
312 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  82.71 
 
 
309 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  80.61 
 
 
295 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  82.71 
 
 
309 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  65.87 
 
 
299 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  61.36 
 
 
295 aa  364  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  64.16 
 
 
295 aa  357  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  58.45 
 
 
300 aa  351  8.999999999999999e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  58.78 
 
 
300 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  59.73 
 
 
293 aa  349  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  60.75 
 
 
297 aa  349  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  57.77 
 
 
300 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  58.7 
 
 
297 aa  343  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  57.34 
 
 
303 aa  343  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  58.02 
 
 
301 aa  342  5e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  58.11 
 
 
305 aa  339  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  56.42 
 
 
305 aa  334  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  53.77 
 
 
290 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  52.56 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  52.54 
 
 
297 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  52.03 
 
 
293 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  52.4 
 
 
293 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  51.01 
 
 
311 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  46.78 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  50.34 
 
 
295 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  49.49 
 
 
291 aa  239  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  47.42 
 
 
311 aa  231  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  47.42 
 
 
294 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  44.48 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  42.66 
 
 
304 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.43 
 
 
289 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  35.4 
 
 
275 aa  180  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  37.16 
 
 
281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  33.79 
 
 
273 aa  176  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  38.57 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  35.84 
 
 
282 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  34.83 
 
 
273 aa  167  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  35 
 
 
312 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.43 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.5 
 
 
272 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  33.86 
 
 
310 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  37.15 
 
 
272 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  36.18 
 
 
272 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  36.46 
 
 
272 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  36.39 
 
 
310 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  34.27 
 
 
334 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  33.23 
 
 
310 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  37 
 
 
272 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  34.58 
 
 
310 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  35.29 
 
 
309 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  33.54 
 
 
310 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  33.54 
 
 
311 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  34.38 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  33.45 
 
 
272 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  33.65 
 
 
308 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  38.24 
 
 
309 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  36.91 
 
 
309 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  35.02 
 
 
287 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  32.76 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  31.27 
 
 
272 aa  146  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  33.02 
 
 
310 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  34.07 
 
 
310 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  34.18 
 
 
306 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  31.46 
 
 
310 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  31.46 
 
 
310 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  32.6 
 
 
310 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  34 
 
 
276 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.54 
 
 
306 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  31.86 
 
 
321 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  34.38 
 
 
314 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  34.89 
 
 
310 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  35.65 
 
 
309 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  32.35 
 
 
296 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  35.31 
 
 
308 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  32.49 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  32.81 
 
 
310 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>