242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0500 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  595  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  91.5 
 
 		 294 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  91.16 
 
 		 294 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  83.67 
 
 		 294 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  83.33 
 
 		 294 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  82.99 
 
 		 294 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  82.31 
 
 		 294 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  82.65 
 
 		 295 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  86.44 
 
 		 309 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  86.44 
 
 		 309 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  86.44 
 
 		 309 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  86.44 
 
 		 309 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  86.44 
 
 		 309 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  85.76 
 
 		 309 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  84.75 
 
 		 309 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  84.41 
 
 		 309 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  86.1 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  85.76 
 
 		 312 aa  481  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  85.08 
 
 		 309 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  83.39 
 
 		 309 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  80.27 
 
 		 295 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  83.39 
 
 		 309 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  83.39 
 
 		 309 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  83.73 
 
 		 309 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  84.41 
 
 		 309 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  83.73 
 
 		 309 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  83.39 
 
 		 309 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  83.39 
 
 		 309 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  65.31 
 
 		 299 aa  374  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  62.37 
 
 		 295 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  59.12 
 
 		 300 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  60.14 
 
 		 300 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  59.04 
 
 		 301 aa  350  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  61.56 
 
 		 297 aa  350  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  63.48 
 
 		 295 aa  350  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  59.86 
 
 		 293 aa  349  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  58.78 
 
 		 300 aa  348  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  59.46 
 
 		 305 aa  347  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  58.78 
 
 		 305 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  59.52 
 
 		 297 aa  346  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  55.74 
 
 		 303 aa  344  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  55.14 
 
 		 290 aa  316  3e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  53.04 
 
 		 297 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  54.45 
 
 		 293 aa  299  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  51.7 
 
 		 298 aa  296  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  52.03 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  51.01 
 
 		 311 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  46.42 
 
 		 292 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  49.15 
 
 		 291 aa  238  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  45.36 
 
 		 311 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  45.36 
 
 		 294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  44.48 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  42.66 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.8 
 
 		 289 aa  192  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  36.3 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  36.99 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.85 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.11 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  37.54 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  37.5 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  33.45 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  37.85 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  34.48 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  36.24 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  34.69 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  36.16 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  32.88 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  36.81 
 
 		 272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  37.03 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  34.8 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  34.89 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  33.54 
 
 		 310 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  33.44 
 
 		 310 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  33.96 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  35.52 
 
 		 272 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  35.29 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  33.54 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  37.54 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  35.16 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  38.56 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  35.9 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  35.02 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  34.17 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  32.19 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  36.3 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  34 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  34.91 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  33.44 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  35.02 
 
 		 314 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  31.86 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  36.28 
 
 		 309 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  31.62 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  35.42 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  35.94 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  33.86 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.23 
 
 		 305 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  33.75 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  34.28 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>