240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1354 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1354  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  559  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.291809  normal  0.536847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1554  protein of unknown function DUF849  97.84 
 
 		 278 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  86.67 
 
 		 280 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  81.88 
 
 		 280 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  81.99 
 
 		 279 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  82.59 
 
 		 283 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  82.18 
 
 		 281 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  61.09 
 
 		 280 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  66.67 
 
 		 274 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  67.78 
 
 		 274 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  66.3 
 
 		 274 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  58.7 
 
 		 283 aa  315  7e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  58.18 
 
 		 281 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  58.7 
 
 		 279 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  56.36 
 
 		 281 aa  298  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  55.56 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  55.35 
 
 		 277 aa  293  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  55.19 
 
 		 274 aa  291  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  54.41 
 
 		 277 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  38.6 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  37.73 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  34.86 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  37.36 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  36.07 
 
 		 287 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  35.79 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  32.1 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.19 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  32.62 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  37.5 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.1 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  37.27 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.27 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  35.74 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  36.67 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.93 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  35.04 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  34.07 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  35.4 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  36.18 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2814  hypothetical protein  30.21 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  34.88 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  32.14 
 
 		 449 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  35.62 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  35.71 
 
 		 281 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  31.6 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  31.6 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  32.48 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  31.6 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  32.19 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  31.85 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  33.9 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  29.83 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  34.45 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  33.11 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  34.24 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  34.24 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  31.96 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  30.32 
 
 		 453 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  34.8 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  34.46 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  29.37 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  34.8 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  34.8 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  34.58 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  30.54 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  34.46 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  31.6 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  30.48 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  35.17 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  30.33 
 
 		 310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  30.71 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  32.25 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  30.8 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  31.88 
 
 		 297 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  34.46 
 
 		 309 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  34.46 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  34.71 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.62 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  33.67 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  34.47 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  31.94 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  31.1 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  33.45 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.9 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  33.1 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  33.56 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  32.19 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  29.67 
 
 		 310 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  29.37 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  32.65 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  32.65 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  32.31 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  32.31 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  32.31 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  32.31 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  30.29 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  31.86 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  32.31 
 
 		 309 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  34.69 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>