228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3856 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3856  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  569  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4735  hypothetical protein  62.66 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0174  hypothetical protein  60.54 
 
 		 280 aa  298  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3667  protein of unknown function DUF849  49.82 
 
 		 278 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3344  protein of unknown function DUF849  51.52 
 
 		 278 aa  255  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4047  hypothetical protein  55.6 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.219165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0345  hypothetical protein  51.41 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0994863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1418  protein of unknown function DUF849  58.27 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1257  hypothetical protein  57.87 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.305303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0083  hypothetical protein  52.96 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1207  protein of unknown function DUF849  57.87 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223998  normal  0.447863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5967  hypothetical protein  48.65 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3957  hypothetical protein  53.75 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5149  protein of unknown function DUF849  49.41 
 
 		 277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0513  hypothetical protein  50.59 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0164851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4505  hypothetical protein  48.71 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01096  hypothetical protein  40.67 
 
 		 281 aa  204  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004321  hypothetical protein  41.2 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0160  hypothetical protein  42.86 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3684  aminotransferase class-III  43.48 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464492 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3479  hypothetical protein  43.27 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3804  hypothetical protein  42.86 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  32.17 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  30.62 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.59 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  27.65 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.2 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  33.61 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  30.04 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  34.24 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.2 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  33.2 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  30.27 
 
 		 296 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.55 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  27.65 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  26.82 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  27.46 
 
 		 281 aa  89  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  26.8 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  26.95 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  28.06 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.8 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  30.08 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  28.28 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  29.04 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  29.77 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  28.68 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  29.64 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.78 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  28.82 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  28.57 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  25.8 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  26.42 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  28.96 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  30.63 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  31.25 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  31.25 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  31.25 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  27.48 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  26.77 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  27.01 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.37 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  30.53 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  26.44 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  29.09 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  30.69 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  28.46 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  30.3 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  27.61 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6838  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.26 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  26.69 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  29.18 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  29.89 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  28.73 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.88 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  29.25 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  28.9 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  27.43 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  27.57 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  28.36 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  26.29 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  24.76 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  30.66 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  27.51 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  29.3 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  28.26 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  28.77 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  26.32 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  33.08 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  26.13 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  29.5 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  23.75 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  29.23 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  26.33 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  29.53 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  29.14 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  29.14 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>