156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01096 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01096  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  584  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004321  hypothetical protein  69.78 
 
 
279 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3667  protein of unknown function DUF849  46.47 
 
 
278 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0345  hypothetical protein  44.03 
 
 
289 aa  221  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0994863  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3344  protein of unknown function DUF849  45.72 
 
 
278 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0083  hypothetical protein  44.85 
 
 
281 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187348  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4047  hypothetical protein  44.79 
 
 
285 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5967  hypothetical protein  41.22 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0513  hypothetical protein  43.89 
 
 
302 aa  198  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0164851  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4735  hypothetical protein  41.98 
 
 
275 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5149  protein of unknown function DUF849  44.92 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3957  hypothetical protein  43.53 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0174  hypothetical protein  42.49 
 
 
280 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3856  hypothetical protein  40.67 
 
 
285 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1418  protein of unknown function DUF849  42.59 
 
 
285 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1257  hypothetical protein  42.86 
 
 
285 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.305303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4505  hypothetical protein  45.7 
 
 
277 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1207  protein of unknown function DUF849  42.47 
 
 
276 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223998  normal  0.447863 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3479  hypothetical protein  40.57 
 
 
264 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805186  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3684  aminotransferase class-III  41.13 
 
 
266 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464492 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3804  hypothetical protein  39.75 
 
 
264 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0160  hypothetical protein  33.88 
 
 
270 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  28.32 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.37 
 
 
289 aa  89  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  26.14 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  26.52 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.17 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  25.43 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.82 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  25.57 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  27.07 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  24.19 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.68 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  25.44 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  25.89 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  24.13 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  27.08 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  27.15 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  26.26 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  25.64 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  25.83 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  25.94 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  23.86 
 
 
280 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  25.45 
 
 
321 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  25.1 
 
 
293 aa  62  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  25.86 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  22.97 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  26.01 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  26.09 
 
 
315 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  27.5 
 
 
281 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  39.76 
 
 
276 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  24.13 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  25.42 
 
 
310 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  23.3 
 
 
304 aa  59.3  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  22.78 
 
 
311 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  22.81 
 
 
310 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  25.19 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  23.03 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  26.45 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  25.51 
 
 
311 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  27.34 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  22.39 
 
 
280 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  26.91 
 
 
272 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  22.41 
 
 
312 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  22.42 
 
 
294 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  24.13 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2143  hypothetical protein  38.27 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3842  hypothetical protein  38.27 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.51 
 
 
272 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  23.94 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  23.34 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  23.79 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  24.25 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1731  hypothetical protein  35.8 
 
 
352 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0191775  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  22.51 
 
 
310 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2044  hypothetical protein  37.04 
 
 
351 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1441  hypothetical protein  37.04 
 
 
351 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1067  hypothetical protein  37.04 
 
 
351 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1352  hypothetical protein  37.04 
 
 
351 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3101  hypothetical protein  37.04 
 
 
351 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2334  hypothetical protein  37.04 
 
 
351 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  24.05 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  24.67 
 
 
299 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  22.71 
 
 
290 aa  52.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  23.69 
 
 
313 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  24.3 
 
 
272 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  25.87 
 
 
309 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  23.92 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7177  hypothetical protein  35.8 
 
 
350 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  24.76 
 
 
309 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  23.66 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  24.22 
 
 
294 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  26.21 
 
 
310 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  21.55 
 
 
297 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6358  hypothetical protein  35.8 
 
 
351 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  23.88 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2818  hypothetical protein  34.57 
 
 
350 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.400926 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2174  hypothetical protein  35.8 
 
 
352 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  24.06 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  23.73 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>