225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1207 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1207  protein of unknown function DUF849  100 
 
 
276 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223998  normal  0.447863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1418  protein of unknown function DUF849  88.41 
 
 
285 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1257  hypothetical protein  88.04 
 
 
285 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.305303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4047  hypothetical protein  73.98 
 
 
285 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0174  hypothetical protein  55.84 
 
 
280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3856  hypothetical protein  57.87 
 
 
285 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3957  hypothetical protein  54.55 
 
 
286 aa  259  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5967  hypothetical protein  54.17 
 
 
284 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4735  hypothetical protein  56.67 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3344  protein of unknown function DUF849  52.73 
 
 
278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3667  protein of unknown function DUF849  52.26 
 
 
278 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0345  hypothetical protein  50.18 
 
 
289 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0994863  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0083  hypothetical protein  54.29 
 
 
281 aa  239  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187348  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0513  hypothetical protein  53.03 
 
 
302 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0164851  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5149  protein of unknown function DUF849  51.66 
 
 
277 aa  231  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4505  hypothetical protein  53.14 
 
 
277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01096  hypothetical protein  42.47 
 
 
281 aa  211  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004321  hypothetical protein  42.16 
 
 
279 aa  199  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0160  hypothetical protein  43.21 
 
 
270 aa  165  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3684  aminotransferase class-III  43.78 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464492 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3479  hypothetical protein  46.44 
 
 
264 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805186  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3804  hypothetical protein  45.19 
 
 
264 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  32.72 
 
 
273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  29.59 
 
 
292 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.01 
 
 
289 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  30.25 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.52 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  26.55 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  31.14 
 
 
293 aa  92.8  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  31.27 
 
 
276 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  28.62 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  24.56 
 
 
449 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.82 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  28.21 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  28.77 
 
 
287 aa  82  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  26.95 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  29.77 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  30.79 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  26.24 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  26.87 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  30.14 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  31.21 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.3 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  26.45 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  26.15 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  29.11 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  28.62 
 
 
283 aa  72  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  29.01 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  31.99 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  27.05 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  28.92 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  27.42 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  29.49 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  25.91 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  28.82 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.81 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  31.54 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  29.28 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  26.57 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  25.5 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  27.81 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.49 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  32.37 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  25.27 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  31.39 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  25.34 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  26.18 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  26.39 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  30.45 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  29.04 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  30.45 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  28.27 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  28.71 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  30.45 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  29.43 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  25.68 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  25.18 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  28.71 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  26.69 
 
 
297 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  29.21 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  31.92 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  28.77 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  26.44 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  29.51 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  26.09 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  25.55 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  28.62 
 
 
279 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  28.42 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  27.57 
 
 
310 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  31.27 
 
 
294 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  26.94 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  26.71 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.08 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  26.14 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  28.26 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  28.15 
 
 
309 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  28.37 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  29.14 
 
 
310 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  30.27 
 
 
293 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  27.15 
 
 
310 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>