137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3804 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3804  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3479  hypothetical protein  96.97 
 
 		 264 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3684  aminotransferase class-III  81.35 
 
 		 266 aa  352  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5149  protein of unknown function DUF849  50 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0160  hypothetical protein  47.5 
 
 		 270 aa  199  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4505  hypothetical protein  50.42 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0083  hypothetical protein  47.04 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3667  protein of unknown function DUF849  45.31 
 
 		 278 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3344  protein of unknown function DUF849  45.31 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5967  hypothetical protein  46.3 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0174  hypothetical protein  44.57 
 
 		 280 aa  174  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4735  hypothetical protein  45.93 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004321  hypothetical protein  42.45 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4047  hypothetical protein  44.4 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.219165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0345  hypothetical protein  42.68 
 
 		 289 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0994863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01096  hypothetical protein  39.45 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3957  hypothetical protein  44.9 
 
 		 286 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0513  hypothetical protein  43.7 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0164851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3856  hypothetical protein  42.35 
 
 		 285 aa  158  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1418  protein of unknown function DUF849  45.45 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1257  hypothetical protein  45.04 
 
 		 285 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.305303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1207  protein of unknown function DUF849  45.45 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223998  normal  0.447863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  31.62 
 
 		 281 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.28 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  30.28 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.43 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  29.92 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  28.4 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  26.18 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  30.31 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  28.95 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  30.5 
 
 		 276 aa  72  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  30.33 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  28.79 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  30.5 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  28.74 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  30.23 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.47 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  28.03 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  28.03 
 
 		 279 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  27.07 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  29.72 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  27.21 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  27.84 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  29.55 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  27.84 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  29.55 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  29.55 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  29.55 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  29.41 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  29.41 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.98 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  30.12 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  27.05 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  29.08 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  28.41 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  25.95 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  27.52 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  26.95 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  26.32 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  28.19 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  28.19 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  28.19 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  24.57 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  24.24 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  28.62 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  24.52 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  27.85 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1354  hypothetical protein  29.12 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.291809  normal  0.536847 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  26.18 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1554  protein of unknown function DUF849  28.74 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  27.85 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.94 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  25.77 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  28.87 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  26.84 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  27.34 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  27.62 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  26.64 
 
 		 310 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4715  hypothetical protein  39.47 
 
 		 351 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  26.81 
 
 		 291 aa  52  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  22.94 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.09 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  27.15 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  25.86 
 
 		 449 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  28.03 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  27.34 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  24.09 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  27.94 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.88 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  27.67 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  25.37 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  27.41 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  25.54 
 
 		 316 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  27.94 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  24.91 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  28.22 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  27.02 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  23.91 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  26.74 
 
 		 310 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>