227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4047 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4047  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1257  hypothetical protein  74.72 
 
 
285 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.305303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1418  protein of unknown function DUF849  75.09 
 
 
285 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1207  protein of unknown function DUF849  73.98 
 
 
276 aa  358  8e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223998  normal  0.447863 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3957  hypothetical protein  57.89 
 
 
286 aa  292  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5967  hypothetical protein  54.51 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4735  hypothetical protein  59.17 
 
 
275 aa  272  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0174  hypothetical protein  54.58 
 
 
280 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0513  hypothetical protein  53.43 
 
 
302 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0164851  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3856  hypothetical protein  55.6 
 
 
285 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3667  protein of unknown function DUF849  55.09 
 
 
278 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3344  protein of unknown function DUF849  54.72 
 
 
278 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0083  hypothetical protein  55.02 
 
 
281 aa  255  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187348  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0345  hypothetical protein  49.63 
 
 
289 aa  254  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0994863  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5149  protein of unknown function DUF849  51.48 
 
 
277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4505  hypothetical protein  52.59 
 
 
277 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01096  hypothetical protein  44.79 
 
 
281 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004321  hypothetical protein  45.66 
 
 
279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0160  hypothetical protein  43.03 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3479  hypothetical protein  47.28 
 
 
264 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805186  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3804  hypothetical protein  46.86 
 
 
264 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3684  aminotransferase class-III  45.78 
 
 
266 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  31.62 
 
 
292 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  31.54 
 
 
273 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  30.25 
 
 
281 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.74 
 
 
289 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  27.27 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  28.94 
 
 
275 aa  96.7  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  31 
 
 
272 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  26.44 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.38 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  31.37 
 
 
272 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.37 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  28.38 
 
 
321 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  26.24 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  28.17 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  31.62 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  27.3 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.63 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  25.87 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  28.78 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  26.88 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  27.53 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.97 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  24.15 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  27.02 
 
 
274 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  24.15 
 
 
449 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.23 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  28.94 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.69 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  32.51 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  26.92 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  29.8 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  29.14 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  25.26 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  31.23 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  29.17 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  26.96 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  26.3 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  25.72 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  28.43 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  25.84 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  25 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  30.22 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  29.18 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  26.62 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  27.95 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  28.22 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  27.99 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  28.22 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  24.48 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  26.71 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  28.22 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  26.56 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  26.37 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  31.38 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  24.26 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  27.95 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  27.15 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  26.35 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  29.66 
 
 
311 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  30.18 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.25 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  27.54 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  24 
 
 
310 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  29.81 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  24.83 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5286  hypothetical protein  25.16 
 
 
355 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  25.96 
 
 
290 aa  63.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5079  hypothetical protein  23.82 
 
 
352 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.72 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  25.64 
 
 
280 aa  63.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  28 
 
 
308 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  26.33 
 
 
303 aa  62.4  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  26.26 
 
 
308 aa  62.4  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  30.59 
 
 
312 aa  62.4  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  26.74 
 
 
288 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  30.59 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  25.81 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  29.6 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>