214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1257 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1257  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  564  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.305303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1418  protein of unknown function DUF849  97.89 
 
 		 285 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1207  protein of unknown function DUF849  88.04 
 
 		 276 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223998  normal  0.447863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4047  hypothetical protein  74.72 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.219165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5967  hypothetical protein  54.38 
 
 		 284 aa  272  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3856  hypothetical protein  57.87 
 
 		 285 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3957  hypothetical protein  53.03 
 
 		 286 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0174  hypothetical protein  52.55 
 
 		 280 aa  258  7e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4735  hypothetical protein  55 
 
 		 275 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3344  protein of unknown function DUF849  51.11 
 
 		 278 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0513  hypothetical protein  52.96 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0164851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3667  protein of unknown function DUF849  51.13 
 
 		 278 aa  244  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0083  hypothetical protein  51.62 
 
 		 281 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0345  hypothetical protein  48.89 
 
 		 289 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0994863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5149  protein of unknown function DUF849  50.55 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4505  hypothetical protein  51.29 
 
 		 277 aa  215  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01096  hypothetical protein  42.86 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004321  hypothetical protein  41.73 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3684  aminotransferase class-III  42.57 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464492 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0160  hypothetical protein  42.39 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3479  hypothetical protein  44.77 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3804  hypothetical protein  44.35 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  32.72 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.32 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.6 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  27.89 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  29.2 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  26.84 
 
 		 273 aa  95.5  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  30.55 
 
 		 276 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  28.11 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.6 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  27.95 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  27.57 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  27.56 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  27.36 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  26.35 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  29.19 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  26.99 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  24.03 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  26.92 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  30.13 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  26.3 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.95 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  29.1 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  30.21 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  27.03 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  30.11 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  29.52 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.89 
 
 		 272 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  26.39 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  26.01 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  25.89 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  26.5 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  27.8 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  29.86 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  26.33 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  28.29 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  30.98 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  27.05 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  25.76 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.01 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  24.92 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  29.64 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  28.47 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  28.47 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  28.47 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  31.29 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  30.28 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  28.62 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  31.4 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  28.48 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  26.56 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  25.4 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  29 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  26.99 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  28.8 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  28.87 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.47 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  28.86 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  24.83 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  28.52 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  28.86 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  28.52 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  28.28 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  26.8 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  28.52 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  30.07 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  26.73 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  27.92 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  26.4 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  25.36 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  28.62 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  27.06 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  24.48 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  26.67 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  23.21 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  27.96 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  24.45 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  27.06 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>