131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0160 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0160  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5149  protein of unknown function DUF849  48.46 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3479  hypothetical protein  47.9 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3804  hypothetical protein  47.48 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4505  hypothetical protein  47.35 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3684  aminotransferase class-III  46.25 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464492 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0083  hypothetical protein  44.44 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3667  protein of unknown function DUF849  42.8 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3344  protein of unknown function DUF849  42.51 
 
 		 278 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5967  hypothetical protein  44.26 
 
 		 284 aa  171  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0174  hypothetical protein  43.53 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0345  hypothetical protein  39.62 
 
 		 289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0994863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4047  hypothetical protein  42.23 
 
 		 285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.219165 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3856  hypothetical protein  42.86 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004321  hypothetical protein  38.87 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4735  hypothetical protein  40.76 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1418  protein of unknown function DUF849  43.03 
 
 		 285 aa  155  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1257  hypothetical protein  42.62 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.305303 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3957  hypothetical protein  43.44 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0513  hypothetical protein  40.86 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0164851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1207  protein of unknown function DUF849  43.21 
 
 		 276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223998  normal  0.447863 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01096  hypothetical protein  33.88 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.51 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  31.4 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  29.11 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  27.85 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  24.12 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.48 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  27.82 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  24.71 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.38 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  25.83 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  25.76 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  26.44 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2818  hypothetical protein  37.8 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2675  hypothetical protein  37.8 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  27.41 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  26.05 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  25.97 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  23.13 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  22.89 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  21.9 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4715  hypothetical protein  34.18 
 
 		 351 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1606  hypothetical protein  35 
 
 		 351 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522694  normal  0.309997 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1441  hypothetical protein  36.59 
 
 		 351 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1731  hypothetical protein  36.59 
 
 		 352 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1587  hypothetical protein  35 
 
 		 351 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  25.42 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2174  hypothetical protein  37.5 
 
 		 352 aa  53.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2044  hypothetical protein  36.59 
 
 		 351 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4842  hypothetical protein  35 
 
 		 351 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174073  normal  0.0113418 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1067  hypothetical protein  36.59 
 
 		 351 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1352  hypothetical protein  36.59 
 
 		 351 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3101  hypothetical protein  36.59 
 
 		 351 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2334  hypothetical protein  36.59 
 
 		 351 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  26.59 
 
 		 287 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2143  hypothetical protein  36.25 
 
 		 352 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3842  hypothetical protein  36.25 
 
 		 351 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  27.49 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  24 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  25.25 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  23.13 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  26.54 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  28.85 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  25.32 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  26.42 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  29.81 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  26.42 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  29.81 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  24.15 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  26.42 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  25.32 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5051  hypothetical protein  38.46 
 
 		 352 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  24.26 
 
 		 294 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  25.27 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1597  hypothetical protein  38.98 
 
 		 356 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  25.27 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  31.43 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  26.4 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  27.48 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  27.91 
 
 		 311 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7177  hypothetical protein  35 
 
 		 350 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6358  hypothetical protein  35 
 
 		 351 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  24.45 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  25.6 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5286  hypothetical protein  40.68 
 
 		 355 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  25.2 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  34.86 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  26.32 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3954  protein of unknown function DUF849  29.49 
 
 		 349 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133735 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5120  hypothetical protein  30 
 
 		 353 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3841  protein of unknown function DUF849  29.49 
 
 		 349 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.839397  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  23.11 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5079  hypothetical protein  36.92 
 
 		 352 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  27.31 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  33.82 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  25.42 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  22.76 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2011  hypothetical protein  37.29 
 
 		 352 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  23.81 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>