210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1597 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1597  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  746    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5286  hypothetical protein  90.88 
 
 		 355 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5051  hypothetical protein  77.71 
 
 		 352 aa  585  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2011  hypothetical protein  78 
 
 		 352 aa  581  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4631  hypothetical protein  76 
 
 		 352 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00375175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3902  hypothetical protein  75.71 
 
 		 352 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2007  hypothetical protein  75.71 
 
 		 352 aa  564  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5079  hypothetical protein  75.71 
 
 		 352 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5120  hypothetical protein  64.18 
 
 		 353 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0020  hypothetical protein  62.75 
 
 		 354 aa  471  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2143  hypothetical protein  59.94 
 
 		 352 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1731  hypothetical protein  59.65 
 
 		 352 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3842  hypothetical protein  60.35 
 
 		 351 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2174  hypothetical protein  60 
 
 		 352 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7177  hypothetical protein  58.79 
 
 		 350 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6358  hypothetical protein  59.48 
 
 		 351 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2334  hypothetical protein  58.55 
 
 		 351 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2044  hypothetical protein  58.55 
 
 		 351 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1441  hypothetical protein  58.55 
 
 		 351 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3101  hypothetical protein  58.55 
 
 		 351 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1067  hypothetical protein  58.55 
 
 		 351 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1352  hypothetical protein  58.55 
 
 		 351 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2675  hypothetical protein  56.57 
 
 		 350 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2818  hypothetical protein  56 
 
 		 350 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400926 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1587  hypothetical protein  57.27 
 
 		 351 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1606  hypothetical protein  58.14 
 
 		 351 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522694  normal  0.309997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4842  hypothetical protein  57.27 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174073  normal  0.0113418 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3841  protein of unknown function DUF849  55.62 
 
 		 349 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.839397  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3954  protein of unknown function DUF849  55.62 
 
 		 349 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133735 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4715  hypothetical protein  56.03 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  27.76 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  24.59 
 
 		 449 aa  106  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  24.92 
 
 		 293 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  26.38 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  27.42 
 
 		 453 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  24.18 
 
 		 275 aa  99.4  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  25.08 
 
 		 273 aa  96.3  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.49 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  26.56 
 
 		 280 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  25.89 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  26.52 
 
 		 312 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  23.25 
 
 		 281 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  24.26 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  27.33 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  27.22 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  23.68 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  24.14 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  22.22 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.82 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  24.45 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  24.16 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  23.42 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  24.2 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  26.6 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  26.27 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  26.46 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  26.17 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  25.82 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.57 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  25.64 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  25.71 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  25.71 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  25.71 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  25 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  25.71 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  26.03 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  25.08 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  24.1 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  25.71 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  25.57 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  25.65 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  23.87 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  25.63 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  23.87 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  24.48 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  23.34 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  24.03 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  25 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  26.28 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  26.28 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  25.48 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  26.28 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  24.92 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  25.71 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  26.28 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  25.08 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  23.91 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.44 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  26.46 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  24.27 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  23.45 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  24.04 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  23.88 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  23.99 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  26.05 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  24.23 
 
 		 279 aa  67  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  25.63 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  26.37 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>