190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0020 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0020  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  739    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5120  hypothetical protein  94.33 
 
 		 353 aa  704    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2007  hypothetical protein  68.47 
 
 		 352 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3902  hypothetical protein  67.33 
 
 		 352 aa  518  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2011  hypothetical protein  67.9 
 
 		 352 aa  515  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5079  hypothetical protein  65.62 
 
 		 352 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5051  hypothetical protein  66.19 
 
 		 352 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4631  hypothetical protein  65.91 
 
 		 352 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00375175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7177  hypothetical protein  68.6 
 
 		 350 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2143  hypothetical protein  68.6 
 
 		 352 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1606  hypothetical protein  68.6 
 
 		 351 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522694  normal  0.309997 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3842  hypothetical protein  68.51 
 
 		 351 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1731  hypothetical protein  67.44 
 
 		 352 aa  495  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6358  hypothetical protein  68.22 
 
 		 351 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1587  hypothetical protein  68.6 
 
 		 351 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2044  hypothetical protein  67.06 
 
 		 351 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1441  hypothetical protein  67.06 
 
 		 351 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4842  hypothetical protein  68.02 
 
 		 351 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174073  normal  0.0113418 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1067  hypothetical protein  67.06 
 
 		 351 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1352  hypothetical protein  67.06 
 
 		 351 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3101  hypothetical protein  67.06 
 
 		 351 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2334  hypothetical protein  67.06 
 
 		 351 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5286  hypothetical protein  63.9 
 
 		 355 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3954  protein of unknown function DUF849  64.84 
 
 		 349 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133735 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2174  hypothetical protein  65.12 
 
 		 352 aa  475  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3841  protein of unknown function DUF849  64.84 
 
 		 349 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.839397  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1597  hypothetical protein  62.75 
 
 		 356 aa  471  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2818  hypothetical protein  63.29 
 
 		 350 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2675  hypothetical protein  62.72 
 
 		 350 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4715  hypothetical protein  60.23 
 
 		 351 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155352  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  26.95 
 
 		 273 aa  103  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  25.24 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  25.89 
 
 		 273 aa  96.7  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  26.56 
 
 		 293 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  23.93 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  26.37 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  24.43 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.04 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  24.16 
 
 		 280 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  25.95 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  26.32 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  24.84 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  24.6 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.06 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  25.65 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  24.53 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  19.44 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  23.65 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  25.16 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  23.47 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  20.9 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  23.1 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  24.19 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  24.04 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  25.96 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  20.55 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  22.04 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  25.16 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  20.38 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  24.29 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  23.96 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  24.84 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  24.45 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  23.66 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  21.52 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  21.84 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  23.34 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  25.47 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  22.65 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  24.83 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  22.8 
 
 		 453 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  21.86 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  23.1 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  23.2 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  21.5 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  23.17 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  24.31 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  22.92 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  22.4 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  24.53 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  25.16 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  22.69 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  24.53 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  24.53 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  21.38 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  24.61 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  22.58 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.82 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  23.03 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  24.46 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  22.4 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  23.81 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  23.88 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  24.62 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  24.21 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  24.84 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  21.31 
 
 		 279 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  21.63 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  24.21 
 
 		 310 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>