133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004321 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004321  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01096  hypothetical protein  69.78 
 
 		 281 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0345  hypothetical protein  48.83 
 
 		 289 aa  231  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0994863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3667  protein of unknown function DUF849  48.52 
 
 		 278 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3344  protein of unknown function DUF849  48.91 
 
 		 278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5967  hypothetical protein  43.61 
 
 		 284 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3957  hypothetical protein  44.53 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5149  protein of unknown function DUF849  44.36 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0083  hypothetical protein  46.93 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0513  hypothetical protein  44.91 
 
 		 302 aa  198  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0164851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4047  hypothetical protein  45.66 
 
 		 285 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.219165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4735  hypothetical protein  44.26 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0174  hypothetical protein  43.89 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4505  hypothetical protein  45.93 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3856  hypothetical protein  41.2 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1418  protein of unknown function DUF849  42.26 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1257  hypothetical protein  41.73 
 
 		 285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.305303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1207  protein of unknown function DUF849  42.16 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223998  normal  0.447863 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3479  hypothetical protein  43.15 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0160  hypothetical protein  38.87 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3804  hypothetical protein  42.32 
 
 		 264 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3684  aminotransferase class-III  42.28 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464492 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.24 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  27.84 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.32 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.61 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  28.52 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.6 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  24.04 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  26.71 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  25.81 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  25.19 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  25.94 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  25.93 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  27.72 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  37.74 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  24.83 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  27.15 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  26.94 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  24.91 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  23.63 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  24.64 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  25.19 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  23.84 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  25.75 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  23.93 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  26.22 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  26.94 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  23.66 
 
 		 453 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2675  hypothetical protein  36.25 
 
 		 350 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  24.19 
 
 		 281 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  26.85 
 
 		 311 aa  52.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  21.55 
 
 		 305 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2818  hypothetical protein  35.37 
 
 		 350 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  25.36 
 
 		 272 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  26.53 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2011  hypothetical protein  21.9 
 
 		 352 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  22.73 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  26.21 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4715  hypothetical protein  35.14 
 
 		 351 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155352  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  26.14 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  25.41 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  23.72 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  25.89 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  21.9 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  25.41 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3954  protein of unknown function DUF849  22.51 
 
 		 349 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133735 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  23.91 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3841  protein of unknown function DUF849  22.51 
 
 		 349 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.839397  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1737  hypothetical protein  39.73 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  21.13 
 
 		 280 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  25.2 
 
 		 272 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  24.17 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.64 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  24.21 
 
 		 304 aa  48.9  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  26.58 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  24.07 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0339  protein of unknown function DUF849  32.46 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124207  normal  0.72562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  23.26 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  24.6 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  23.61 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  23.72 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6838  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.3 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5079  hypothetical protein  21.14 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3440  protein of unknown function DUF849  43.33 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  24.91 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1606  hypothetical protein  31.25 
 
 		 351 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522694  normal  0.309997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  24.91 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  23.79 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2174  hypothetical protein  33.75 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2044  hypothetical protein  33.75 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3842  hypothetical protein  31.33 
 
 		 351 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.83 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1441  hypothetical protein  33.75 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  21.63 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1067  hypothetical protein  33.75 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1352  hypothetical protein  33.75 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3101  hypothetical protein  33.75 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2334  hypothetical protein  33.75 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  23.88 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>