164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3440 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3440  protein of unknown function DUF849  100 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1737  hypothetical protein  83.97 
 
 		 291 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0339  protein of unknown function DUF849  59.3 
 
 		 292 aa  322  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124207  normal  0.72562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2519  protein of unknown function DUF849  55.65 
 
 		 343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4725  hypothetical protein  28.67 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  28.52 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  30.48 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3085  hypothetical protein  26.4 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  30.51 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  28.18 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  29.87 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  29.87 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  29.87 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  29.49 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  29.55 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  28.21 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  26.12 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  26.8 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1770  hypothetical protein  28.3 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3440  protein of unknown function DUF849  27.63 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  28.9 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  28.9 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  28.37 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  28.23 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  28.23 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  29.15 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  29.15 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  28.57 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  28.23 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  28.23 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  30.94 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  27.49 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  28.47 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  26.74 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  24.08 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  28.81 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  26.58 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  27.24 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  27.36 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  28.43 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  28.87 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  28.71 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  29.77 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.28 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  26.58 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  26.79 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.69 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  29.69 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  26.25 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  30.58 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  30.47 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  27.99 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  27.05 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  28.38 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  28.87 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  29.13 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  26.04 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  28.91 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  24.39 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  28.91 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  28.91 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  26.67 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  26.04 
 
 		 453 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  27.61 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  29.04 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  27.59 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.17 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.38 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.35 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  27.05 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  27.91 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  26.76 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  26.56 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  25.77 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  26.9 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  27.3 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  26.44 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  27.95 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  27.65 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  26.46 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  29.47 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  25.52 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  26.01 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  27.3 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  29.29 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  24.66 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  26.07 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  27.24 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  24.76 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  27.44 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  25.52 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.14 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  27.3 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  26.33 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.65 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  26.99 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  26.3 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  27.3 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  27.01 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  24.6 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>