189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1770 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1770  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4725  hypothetical protein  32.15 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  32.17 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  32.58 
 
 		 282 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3085  hypothetical protein  28.12 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  30 
 
 		 273 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  28.85 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.37 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  30.99 
 
 		 272 aa  100  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  28.8 
 
 		 293 aa  96.3  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  28.84 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  28.89 
 
 		 273 aa  94  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.97 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.67 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  29.06 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.21 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  26.05 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  28.53 
 
 		 306 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  28.05 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  28.09 
 
 		 310 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  26.02 
 
 		 281 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  27.47 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  26.75 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  28.92 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  28.92 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  28.84 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3440  protein of unknown function DUF849  28.3 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  28.8 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1737  hypothetical protein  31.21 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  28.44 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  27.08 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  28.17 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  28.84 
 
 		 272 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  24.21 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  26.16 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  27.27 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  25.08 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  24.53 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  29.43 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  28.48 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.8 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  26.14 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  26.75 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  26.18 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  24.85 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  23.9 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  27.1 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  27.33 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3440  protein of unknown function DUF849  27.41 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.56 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  24.53 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  24.93 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  27.53 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.28 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  28.26 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  28.07 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  27.55 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  24.62 
 
 		 280 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  26.96 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  25.32 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  26.69 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  25.81 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  27.22 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  28.13 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  28.01 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  24.93 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  24.92 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  27.66 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2814  hypothetical protein  27.41 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  27.02 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  27.44 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  27.36 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  27.36 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  25.47 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  27.41 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  27.36 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  25.96 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  25.15 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  28.31 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  24.46 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  24.38 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6838  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.16 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  26.28 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  25.31 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  25.62 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  27.36 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  25.54 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  26.23 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  25.62 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  27.36 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  26.23 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  29.25 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  25.85 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  27.36 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  25.93 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  25.93 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  25.93 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  25.93 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  25.62 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>