167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1737 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1737  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3440  protein of unknown function DUF849  83.97 
 
 
296 aa  478  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0339  protein of unknown function DUF849  59.93 
 
 
292 aa  317  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124207  normal  0.72562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2519  protein of unknown function DUF849  58.16 
 
 
343 aa  245  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  28.97 
 
 
298 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3085  hypothetical protein  26.71 
 
 
299 aa  92.4  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4725  hypothetical protein  29.66 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  29.14 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  29.14 
 
 
294 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  29.39 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  29.39 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  29.39 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  29.47 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  29.14 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  29.03 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  28.81 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  29.14 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  28.81 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1770  hypothetical protein  31.21 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  26.55 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  28.52 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  31.16 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  28.57 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.39 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  28.37 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  28.38 
 
 
312 aa  77  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  28.32 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  27.78 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.52 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  30.34 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  27.96 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  28.28 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  30 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  25.52 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  27.43 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  27.15 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  27.42 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  29.03 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  27.68 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  27.68 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  27.34 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  27.34 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  27.34 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  27.34 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3440  protein of unknown function DUF849  25 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  29.03 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  26.12 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  29.48 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  29.47 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  29.57 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  29.57 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  27.34 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  31.42 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  27.8 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  28.67 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  27.83 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  27.42 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.72 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  27.56 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  26.8 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  25.17 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  27.24 
 
 
274 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  27.93 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  27.93 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  27.72 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  28.46 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  28.62 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  24.41 
 
 
449 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  28.57 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  26.99 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  27.24 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  27.72 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  28.67 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  26.41 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  28.15 
 
 
453 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  28.73 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  28.52 
 
 
281 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  28.52 
 
 
280 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  62.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  26.09 
 
 
301 aa  62.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  26.46 
 
 
288 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  26.46 
 
 
288 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  25.52 
 
 
299 aa  62.4  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  26.01 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  28.91 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  26.94 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  27.04 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  27.49 
 
 
288 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  29.89 
 
 
321 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  27.66 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.76 
 
 
294 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  27.46 
 
 
311 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.69 
 
 
305 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  28.95 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  28.28 
 
 
283 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  26.79 
 
 
310 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  27.36 
 
 
279 aa  58.9  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  28.8 
 
 
310 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  25.77 
 
 
290 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  28.28 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>