231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4505 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4505  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  545  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5149  protein of unknown function DUF849  88.09 
 
 		 277 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3667  protein of unknown function DUF849  55.91 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3344  protein of unknown function DUF849  55.12 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0083  hypothetical protein  56.03 
 
 		 281 aa  265  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5967  hypothetical protein  51.74 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0345  hypothetical protein  51.97 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0994863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0174  hypothetical protein  51.87 
 
 		 280 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4047  hypothetical protein  52.59 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.219165 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3957  hypothetical protein  51.09 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0513  hypothetical protein  52.12 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0164851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4735  hypothetical protein  51.42 
 
 		 275 aa  234  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3856  hypothetical protein  48.71 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1418  protein of unknown function DUF849  52.03 
 
 		 285 aa  221  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1257  hypothetical protein  51.29 
 
 		 285 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.305303 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004321  hypothetical protein  44.89 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01096  hypothetical protein  45.7 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1207  protein of unknown function DUF849  53.14 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223998  normal  0.447863 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3479  hypothetical protein  52.67 
 
 		 264 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0160  hypothetical protein  48.46 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3684  aminotransferase class-III  51.79 
 
 		 266 aa  198  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464492 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3804  hypothetical protein  51.85 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  34.77 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  30.82 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.1 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  27.6 
 
 		 273 aa  98.6  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.06 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  26.53 
 
 		 296 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  30.51 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  26.49 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  31.11 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  31.65 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  31.65 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  31.63 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  30.67 
 
 		 321 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  27.65 
 
 		 326 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  30.64 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  25.49 
 
 		 310 aa  89  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  27.87 
 
 		 310 aa  88.6  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  29.83 
 
 		 296 aa  88.6  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  31.31 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  28.98 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.04 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  29.63 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  29.93 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  32.23 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.82 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  29.29 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  28.71 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  28.48 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  27.78 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  29.43 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  28.71 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  28.2 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  30.15 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  28.1 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  30.59 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  29.35 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  29.29 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  29.84 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  29.96 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  27.72 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  28.88 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.8 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  28.2 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  26.71 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  27.6 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  25.98 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  29.51 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  30.54 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  29.51 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  29.51 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  27.54 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  27.54 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  29.51 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  27.54 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  30.14 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  26.64 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  28.62 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  30.14 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  27.21 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  30.27 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  27.15 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  28.93 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  27.78 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  29.18 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  29.18 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  30.54 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  29.08 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  30.36 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  27.15 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  30.17 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.93 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  29.55 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  29.39 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  29.54 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  27.46 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  28.2 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  31.27 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  27.72 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>