71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1923 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  100 
 
 		 302 aa  599  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  61.26 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  61.26 
 
 		 302 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  61.26 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  61.26 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  61.59 
 
 		 302 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  61.59 
 
 		 302 aa  364  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  61.59 
 
 		 302 aa  364  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  60.6 
 
 		 302 aa  361  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  60.26 
 
 		 302 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  60.6 
 
 		 302 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  60.93 
 
 		 302 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  59.6 
 
 		 302 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  60.67 
 
 		 302 aa  346  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  60.67 
 
 		 303 aa  342  4e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  58.28 
 
 		 302 aa  342  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  61.54 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  56.95 
 
 		 302 aa  333  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  56 
 
 		 295 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  55.67 
 
 		 295 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  54.3 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  52.51 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  49.83 
 
 		 301 aa  258  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  48.67 
 
 		 301 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  47 
 
 		 301 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  48.5 
 
 		 299 aa  242  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  48.12 
 
 		 295 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  46.67 
 
 		 293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  46.03 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  48.16 
 
 		 293 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  41.8 
 
 		 309 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  44.67 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  40.6 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  40.33 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  40.33 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  40.33 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  40.33 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  41 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  41.02 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  36.28 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  38.85 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  38.22 
 
 		 326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  36.07 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  34.41 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  32.97 
 
 		 269 aa  126  5e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  35.4 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  36.06 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  36.06 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  31.21 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  31.03 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  30.86 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  30.69 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  28.4 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  39.67 
 
 		 367 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  38.04 
 
 		 367 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  33.54 
 
 		 331 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0685  Baseplate J family protein  31.11 
 
 		 312 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  42.86 
 
 		 114 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01990  hypothetical protein  27.84 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3669  bacteriophage baseplate assembly protein J  41.9 
 
 		 108 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  32.62 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  31.35 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  32.09 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  32.09 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  34.98 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  30.11 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  32.74 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  33.51 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  32.2 
 
 		 389 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  25.41 
 
 		 372 aa  48.9  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  28.08 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>