55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3669 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3669  bacteriophage baseplate assembly protein J  100 
 
 
108 aa  217  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  97.22 
 
 
114 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  94.29 
 
 
301 aa  201  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  71.03 
 
 
301 aa  157  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  70.09 
 
 
301 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  39.81 
 
 
297 aa  90.1  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  39.81 
 
 
297 aa  90.1  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  40.78 
 
 
297 aa  90.1  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  40.78 
 
 
297 aa  90.1  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  45.19 
 
 
305 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  44.12 
 
 
298 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  38.83 
 
 
296 aa  85.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  42.16 
 
 
302 aa  81.3  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  41.9 
 
 
302 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  41.18 
 
 
302 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  40.2 
 
 
299 aa  77.4  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  41.24 
 
 
295 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  37.25 
 
 
302 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  38.1 
 
 
302 aa  73.9  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  35.92 
 
 
302 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  35.92 
 
 
302 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  35.92 
 
 
302 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  36.79 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  37.25 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  39.81 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  34.95 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  37.25 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  36.27 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  36.27 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  37.86 
 
 
298 aa  70.5  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  37.86 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  35.92 
 
 
302 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  38.83 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  37.86 
 
 
303 aa  67  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  37.62 
 
 
298 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  37.25 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  34.31 
 
 
302 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  33.98 
 
 
293 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  34.95 
 
 
293 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  35.51 
 
 
371 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  42.86 
 
 
289 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  34.58 
 
 
371 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  34.58 
 
 
371 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  34.02 
 
 
296 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  28.57 
 
 
331 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  31.31 
 
 
326 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  36.36 
 
 
331 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  35.71 
 
 
326 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  37.27 
 
 
298 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  35.51 
 
 
367 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  43.86 
 
 
349 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  32.71 
 
 
367 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  40.35 
 
 
349 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  30.56 
 
 
377 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  30.3 
 
 
303 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>