70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2092 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  100 
 
 
302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  84.44 
 
 
302 aa  512  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  73.51 
 
 
302 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  71.52 
 
 
302 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  71.52 
 
 
302 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  71.85 
 
 
302 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  69.21 
 
 
302 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  69.67 
 
 
303 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  68.54 
 
 
302 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  66.56 
 
 
302 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  66.56 
 
 
302 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  66.56 
 
 
302 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  66.23 
 
 
302 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  64.9 
 
 
302 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  64.9 
 
 
302 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  65.56 
 
 
302 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  60.6 
 
 
302 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  58.86 
 
 
303 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  61.33 
 
 
295 aa  345  7e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  59.33 
 
 
295 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  55.96 
 
 
298 aa  322  6e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  55.52 
 
 
305 aa  308  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  50.67 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  49.15 
 
 
295 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  48.33 
 
 
293 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  46.46 
 
 
301 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  44.97 
 
 
299 aa  249  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  45.79 
 
 
301 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  46.33 
 
 
296 aa  242  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  45.95 
 
 
301 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  41.8 
 
 
309 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  46.15 
 
 
293 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  44.04 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  43.71 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  43.71 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  44.04 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  42.67 
 
 
298 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  39.4 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  37 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  38.23 
 
 
326 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  39.13 
 
 
289 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  37.54 
 
 
279 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  38.26 
 
 
298 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  34.88 
 
 
263 aa  143  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  34.06 
 
 
269 aa  143  5e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  36.04 
 
 
285 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  36.04 
 
 
285 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  30.67 
 
 
285 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  29.77 
 
 
290 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  34.65 
 
 
331 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  32.13 
 
 
303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  28.84 
 
 
349 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  35.38 
 
 
367 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  34.74 
 
 
367 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  29.5 
 
 
349 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  29.91 
 
 
331 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01990  hypothetical protein  27.68 
 
 
337 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0685  Baseplate J family protein  29.9 
 
 
312 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  33.2 
 
 
263 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  32.09 
 
 
371 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  32.09 
 
 
371 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  31.55 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  30.86 
 
 
369 aa  79.7  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  28.76 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  31.18 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  35.92 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3669  bacteriophage baseplate assembly protein J  35.92 
 
 
108 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  26.83 
 
 
372 aa  65.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  38.71 
 
 
388 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  29.51 
 
 
387 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>