64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2382 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  100 
 
 		 349 aa  696    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  78.22 
 
 		 349 aa  554  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  32.18 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  31.95 
 
 		 302 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  31.21 
 
 		 302 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  30.45 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  30.45 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  31.63 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  30.45 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  33.55 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  31.75 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  30.96 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  30.63 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  32.97 
 
 		 295 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  31.35 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  29.5 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  30.67 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  29.81 
 
 		 302 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  29.81 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  30.86 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  30.37 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  32.73 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  32.23 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  29.73 
 
 		 302 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  31.5 
 
 		 296 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  32 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  29.85 
 
 		 295 aa  99.8  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  32 
 
 		 303 aa  99.4  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  32.85 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  28.94 
 
 		 297 aa  97.1  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  28.94 
 
 		 297 aa  97.1  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  28.94 
 
 		 297 aa  95.9  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  28.94 
 
 		 297 aa  95.9  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  29.7 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  32 
 
 		 289 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  29.97 
 
 		 293 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  29.93 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  32.64 
 
 		 263 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  27.48 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  28.52 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  26.9 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  28.57 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  28.48 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  28.07 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  30.74 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  25.94 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0685  Baseplate J family protein  27.04 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  29.24 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  27.27 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  24.44 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  31.31 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  27.15 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  23.53 
 
 		 263 aa  55.8  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  28.79 
 
 		 367 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  24.7 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  26.98 
 
 		 285 aa  49.7  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  26.98 
 
 		 285 aa  49.7  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  45.61 
 
 		 114 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  27.91 
 
 		 371 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  27.91 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3669  bacteriophage baseplate assembly protein J  43.86 
 
 		 108 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  29.22 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  26.74 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  27.88 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>