67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1575 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  100 
 
 		 367 aa  745    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  94.01 
 
 		 367 aa  705    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  56.87 
 
 		 371 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  56.87 
 
 		 371 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  56.6 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  46.38 
 
 		 377 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  35.51 
 
 		 369 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  34.15 
 
 		 374 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  32.07 
 
 		 372 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  41.53 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  37.7 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  37.7 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  37.16 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  37.16 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  39.56 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  35.38 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  39.13 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  36.81 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  39.66 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  39.11 
 
 		 302 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  37.7 
 
 		 295 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  36.07 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  37.91 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  37.91 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  37.91 
 
 		 302 aa  106  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  37.91 
 
 		 302 aa  106  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  33.9 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  33.47 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  36.26 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  36.56 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  37.91 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  35.16 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  35.16 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  39.34 
 
 		 305 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  36.26 
 
 		 303 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  38.04 
 
 		 302 aa  96.3  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  36.26 
 
 		 303 aa  96.3  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  38.38 
 
 		 301 aa  93.2  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  33.87 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  24.37 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  32.97 
 
 		 293 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  33.95 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  35.16 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  33.51 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  29.12 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  37.22 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  32.6 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  30.43 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  34.87 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  30.23 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  32.96 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  33.33 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  26.76 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  33.73 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  28.42 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  27.36 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  31.95 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  27.83 
 
 		 326 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  28.79 
 
 		 349 aa  53.1  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  26.63 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  26.37 
 
 		 351 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  36.11 
 
 		 114 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  27.98 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3669  bacteriophage baseplate assembly protein J  35.51 
 
 		 108 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  26.32 
 
 		 303 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2511  hypothetical protein  31.65 
 
 		 106 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  31.39 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>