62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0932 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  100 
 
 
369 aa  755    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  40.73 
 
 
374 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  36.44 
 
 
372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  35.51 
 
 
367 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  35.51 
 
 
367 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  34.92 
 
 
371 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  34.92 
 
 
371 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  34.92 
 
 
371 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  32.5 
 
 
377 aa  179  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2511  hypothetical protein  52.88 
 
 
106 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  33.53 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  32.8 
 
 
298 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  30.89 
 
 
297 aa  90.5  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  30.89 
 
 
297 aa  90.5  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  32.93 
 
 
297 aa  90.1  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  32.93 
 
 
297 aa  90.1  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  33.33 
 
 
302 aa  89.7  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  27.54 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  29.47 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  33.33 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  33.33 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  28.95 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  28.95 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  28.95 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  28.95 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  28.95 
 
 
302 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  29.41 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  30.86 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  30.86 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  32.72 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  27.37 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  30 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  27.37 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  33.73 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  29.88 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  32.52 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  33.13 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  29.56 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  32.93 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  30.11 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  29.57 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  27.16 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  29.88 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  30.86 
 
 
295 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  26.71 
 
 
298 aa  59.7  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  28.32 
 
 
301 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  28.05 
 
 
301 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  28.92 
 
 
285 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  31.68 
 
 
289 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  23.2 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  31.33 
 
 
279 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  23.38 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  23.38 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  27.98 
 
 
689 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  31.18 
 
 
298 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  30.16 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  36.63 
 
 
469 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  28.26 
 
 
656 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  23.59 
 
 
326 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  35.64 
 
 
469 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  29.67 
 
 
269 aa  43.1  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  35.64 
 
 
469 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>