51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3832 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  955    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  96.59 
 
 
469 aa  931    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  97.87 
 
 
469 aa  942    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  33.87 
 
 
503 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  33.87 
 
 
503 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  28.76 
 
 
833 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  27.68 
 
 
986 aa  99.8  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  27.18 
 
 
692 aa  97.8  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  28.19 
 
 
677 aa  97.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  26.64 
 
 
1008 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  25.5 
 
 
843 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  26.44 
 
 
1183 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  28.32 
 
 
1088 aa  91.3  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  30.5 
 
 
1168 aa  90.9  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  28.94 
 
 
1101 aa  84  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  28.18 
 
 
644 aa  83.6  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  24.45 
 
 
854 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  27.81 
 
 
650 aa  81.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  25.89 
 
 
1203 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  29.78 
 
 
1080 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  26.26 
 
 
957 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  29.89 
 
 
1119 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  29.48 
 
 
653 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  29.32 
 
 
650 aa  73.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  25.94 
 
 
833 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  25.87 
 
 
1744 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  27.51 
 
 
649 aa  69.3  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  33.7 
 
 
730 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  26.38 
 
 
656 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  26.85 
 
 
651 aa  67  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  28.47 
 
 
706 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  28.78 
 
 
676 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  33.96 
 
 
676 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  26.06 
 
 
647 aa  64.3  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  30.39 
 
 
796 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  25.35 
 
 
1030 aa  63.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  26.42 
 
 
737 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  28.21 
 
 
814 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  25.44 
 
 
649 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  26.79 
 
 
652 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  24.24 
 
 
647 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2552  hypothetical protein  25.94 
 
 
939 aa  55.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  25.15 
 
 
760 aa  55.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1812  hypothetical protein  31.36 
 
 
773 aa  53.5  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  28.16 
 
 
785 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1140  hypothetical protein  40.24 
 
 
391 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  20.91 
 
 
1332 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1746  hypothetical protein  40.51 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.681924  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  24.24 
 
 
289 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2553  hypothetical protein  36.59 
 
 
397 aa  47.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188731 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  35.64 
 
 
369 aa  43.1  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>