70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4339 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  100 
 
 		 302 aa  608  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  98.68 
 
 		 302 aa  600  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  84.11 
 
 		 302 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  79.14 
 
 		 302 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  76.16 
 
 		 302 aa  474  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  74.17 
 
 		 302 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  71.52 
 
 		 302 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  71.52 
 
 		 302 aa  444  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  68.54 
 
 		 302 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  66.23 
 
 		 302 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  66.56 
 
 		 302 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  66.23 
 
 		 302 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  66.23 
 
 		 302 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  66.33 
 
 		 303 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  63.91 
 
 		 302 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  63.91 
 
 		 302 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  64.55 
 
 		 303 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  61.59 
 
 		 302 aa  364  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  59.27 
 
 		 295 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  56.62 
 
 		 295 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  56.19 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  55.3 
 
 		 298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  48.81 
 
 		 295 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  48.15 
 
 		 301 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  47.14 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  47.32 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  46.67 
 
 		 298 aa  255  8e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  45.61 
 
 		 301 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  46.33 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  46.33 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  45.67 
 
 		 296 aa  238  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  46 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  46 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  44 
 
 		 293 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  39.23 
 
 		 309 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  45.85 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  42 
 
 		 298 aa  199  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  41.02 
 
 		 296 aa  199  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  37.5 
 
 		 326 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  44.44 
 
 		 289 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  39.02 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  40.61 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  36.54 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  36.23 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  34.49 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  38.72 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  38.72 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  34.93 
 
 		 303 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  32.01 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  31.75 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  31.37 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  30.31 
 
 		 331 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  30.41 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  31 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  38.46 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  33.47 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0685  Baseplate J family protein  30.32 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  34.95 
 
 		 371 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  34.95 
 
 		 371 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  34.41 
 
 		 371 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01990  hypothetical protein  25.15 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  27.37 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  32.18 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3669  bacteriophage baseplate assembly protein J  37.25 
 
 		 108 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  37.25 
 
 		 114 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  35.64 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  29.19 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  38.14 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  27.17 
 
 		 372 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  30.77 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>