70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_08030 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  100 
 
 
295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  79.66 
 
 
295 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  61.33 
 
 
302 aa  349  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  61.26 
 
 
302 aa  349  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  61.33 
 
 
302 aa  349  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  61.59 
 
 
302 aa  349  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  59.93 
 
 
303 aa  349  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  61 
 
 
302 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  61.33 
 
 
302 aa  345  7e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  59.67 
 
 
302 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  59.87 
 
 
302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  59.67 
 
 
302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  59.27 
 
 
302 aa  331  9e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  58.47 
 
 
302 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  58.8 
 
 
302 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  59.6 
 
 
302 aa  329  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  59.27 
 
 
302 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  59.2 
 
 
303 aa  323  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  57.28 
 
 
302 aa  314  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  55.67 
 
 
302 aa  295  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  50.51 
 
 
298 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  53.47 
 
 
305 aa  281  9e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  48.97 
 
 
299 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  50 
 
 
293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  49.66 
 
 
296 aa  268  7e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  50.52 
 
 
293 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  50.5 
 
 
298 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  44.48 
 
 
309 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  48.46 
 
 
295 aa  246  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  46.94 
 
 
297 aa  242  7e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  46.94 
 
 
297 aa  242  7e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  46.28 
 
 
297 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  46.28 
 
 
297 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  46.64 
 
 
301 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  40.19 
 
 
326 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  44.1 
 
 
326 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  44.44 
 
 
301 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  44.63 
 
 
301 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  44.33 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  39.65 
 
 
296 aa  205  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  42.76 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  40.61 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  37.25 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  33.45 
 
 
269 aa  150  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  32.4 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  34.21 
 
 
290 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  39.47 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  39.47 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  30.9 
 
 
303 aa  122  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  32.97 
 
 
349 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  38.8 
 
 
367 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  30.94 
 
 
331 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  31.52 
 
 
349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  34.6 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  37.7 
 
 
367 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  29.51 
 
 
285 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  35.25 
 
 
263 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  33.16 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  33.16 
 
 
371 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  33.16 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01990  hypothetical protein  26.17 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0685  Baseplate J family protein  28.12 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  35.48 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  40.78 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3669  bacteriophage baseplate assembly protein J  39.81 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  41.49 
 
 
388 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  30.86 
 
 
369 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  27.37 
 
 
372 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  29.41 
 
 
374 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  29.78 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>