32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1929 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  100 
 
 		 360 aa  709    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1947  Baseplate J family protein  74.72 
 
 		 360 aa  527  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  29.38 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  30.55 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  28.98 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  27.47 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  29.39 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  30.6 
 
 		 689 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  27.49 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  27.71 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  26.73 
 
 		 302 aa  53.1  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  29.17 
 
 		 374 aa  53.1  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  28.28 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  30.81 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  26.79 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  29.38 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  29.62 
 
 		 351 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0687  hypothetical protein  26.57 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5069  hypothetical protein  26.57 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.418785  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  23.68 
 
 		 376 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0255  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  30.37 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0714  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  26.51 
 
 		 387 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  29.78 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  28.08 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  33.54 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  26.91 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  26.91 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  29.48 
 
 		 299 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  26.28 
 
 		 346 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  25.52 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  26.91 
 
 		 302 aa  43.1  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  26.7 
 
 		 298 aa  42.7  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>