22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0714 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0714  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  100 
 
 		 387 aa  790    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0687  hypothetical protein  43.38 
 
 		 390 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5069  hypothetical protein  43.38 
 
 		 390 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.418785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2920  phage protein  42.64 
 
 		 394 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0981084  hitchhiker  0.00000000000183456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2785  phage protein  42.38 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3476  phage protein  42.64 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149492 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1043  hypothetical protein, putative phage gene  40.16 
 
 		 394 aa  309  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0912  putative phage gene  41.39 
 
 		 394 aa  295  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0932  putative bacteriophage protein  41.56 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.374954  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0738  putative bacteriophage protein  41.82 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  37.91 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1300  putative bacteriophage protein  41.04 
 
 		 400 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  36.67 
 
 		 403 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  36.67 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0572  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  35.6 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.415024  normal  0.27135 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1039  hypothetical protein  36.08 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0255  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  37.5 
 
 		 396 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1489  hypothetical protein  35.25 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372871  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  32.7 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  26.52 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  26.51 
 
 		 360 aa  46.2  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  28.8 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>